More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2731 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
472 aa  941    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  56.59 
 
 
450 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  42.36 
 
 
458 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.74 
 
 
461 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  37.28 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  39.1 
 
 
463 aa  279  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  39.32 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.68 
 
 
464 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.92 
 
 
479 aa  266  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  38.26 
 
 
459 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  34.12 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  38.12 
 
 
468 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  34.99 
 
 
479 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  34.27 
 
 
479 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  34.69 
 
 
479 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  36.64 
 
 
462 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  36.64 
 
 
462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  33.55 
 
 
473 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  35.04 
 
 
474 aa  249  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  39.64 
 
 
461 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.19 
 
 
461 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  34.42 
 
 
458 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.5 
 
 
472 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.43 
 
 
465 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  34.28 
 
 
499 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  37.34 
 
 
466 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  38.61 
 
 
476 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  35.88 
 
 
465 aa  236  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 
456 aa  233  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  33.91 
 
 
473 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.93 
 
 
444 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  36.61 
 
 
465 aa  230  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 
465 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  36.8 
 
 
465 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  33.55 
 
 
456 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  35.82 
 
 
460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  34.76 
 
 
477 aa  220  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.92 
 
 
478 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 
470 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  33.9 
 
 
602 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  34.2 
 
 
463 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  35.19 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  33.83 
 
 
461 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  34.3 
 
 
456 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.42 
 
 
473 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  35.51 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  34.12 
 
 
466 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 
462 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.45 
 
 
462 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  31.45 
 
 
462 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.75 
 
 
478 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  31 
 
 
462 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.77 
 
 
469 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.73 
 
 
596 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  34.3 
 
 
764 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  34.15 
 
 
461 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
758 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 
460 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
726 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  31.34 
 
 
465 aa  166  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 
753 aa  166  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  34.16 
 
 
752 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  35.21 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.72 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.65 
 
 
734 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.44 
 
 
448 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 
775 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  30.87 
 
 
467 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.39 
 
 
459 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 
484 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.19 
 
 
490 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  34.25 
 
 
474 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.75 
 
 
444 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.41 
 
 
449 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  30.87 
 
 
470 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  27.31 
 
 
444 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.71 
 
 
436 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 
492 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
754 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  33.91 
 
 
487 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.28 
 
 
448 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.49 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.59 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.78 
 
 
448 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.78 
 
 
532 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 
481 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.12 
 
 
474 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  29.6 
 
 
468 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.44 
 
 
445 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.24 
 
 
456 aa  123  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.36 
 
 
495 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25.11 
 
 
705 aa  120  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.75 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 
473 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.54 
 
 
436 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  27.11 
 
 
805 aa  113  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.11 
 
 
805 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>