More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4807 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
507 aa  1045    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3765  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.23 
 
 
495 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378557  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.11 
 
 
805 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  36.11 
 
 
805 aa  280  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  34.17 
 
 
459 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 
462 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 
489 aa  216  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  31.44 
 
 
446 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.75 
 
 
456 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
454 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  27.51 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  27.87 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0156  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.41 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932448  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  30.37 
 
 
461 aa  173  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 
461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.22 
 
 
479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  27.97 
 
 
479 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.22 
 
 
472 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  28.48 
 
 
463 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  28.84 
 
 
463 aa  153  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  26.62 
 
 
479 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  26.74 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  27.68 
 
 
459 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  25.69 
 
 
474 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  26.29 
 
 
448 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.69 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  27.04 
 
 
473 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 
464 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  28.93 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  27.79 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.7 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  25.63 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.77 
 
 
468 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.58 
 
 
473 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  26.42 
 
 
478 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.97 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  27.73 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  25.11 
 
 
462 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  26.67 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.64 
 
 
465 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  27.71 
 
 
473 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 
476 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  27.78 
 
 
465 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  28.54 
 
 
477 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  35.86 
 
 
466 aa  120  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.41 
 
 
448 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  30.57 
 
 
705 aa  120  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  26.98 
 
 
477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.08 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.1 
 
 
469 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  35.27 
 
 
602 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 
465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  37.83 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  30.67 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  27.11 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  27.91 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1671  FAD linked oxidase domain protein  26.59 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012602  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.96 
 
 
481 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  27.6 
 
 
461 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  40.94 
 
 
465 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 
447 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  27.25 
 
 
460 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  37.81 
 
 
456 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.89 
 
 
448 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.1 
 
 
474 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.37 
 
 
445 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 
466 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  27.62 
 
 
465 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  25.53 
 
 
456 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.2 
 
 
436 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  26.12 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  25.98 
 
 
752 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.9 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.39 
 
 
490 aa  99  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 
490 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.82 
 
 
764 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  31.38 
 
 
563 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  32.84 
 
 
444 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  28.01 
 
 
449 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.64 
 
 
891 aa  94.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  31.86 
 
 
444 aa  94  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  30.8 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03083  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02770)  25 
 
 
531 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315128  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  34.32 
 
 
473 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  28.27 
 
 
458 aa  91.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  34.22 
 
 
491 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  35.9 
 
 
532 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.99 
 
 
734 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.07 
 
 
896 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.07 
 
 
896 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  36.2 
 
 
758 aa  90.1  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  29.49 
 
 
545 aa  90.1  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 
502 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.37 
 
 
896 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 
450 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 
864 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.18 
 
 
614 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 
439 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.18 
 
 
864 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>