More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3765 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3765  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 495 aa  1010    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.23 
 
 		 507 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.87 
 
 		 805 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  35.65 
 
 		 805 aa  259  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  33.85 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  30.6 
 
 		 489 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  33.11 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.08 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11802  oxidoreductase  31.36 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547261 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  28.31 
 
 		 461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0156  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.67 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  29.96 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  26.48 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.13 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.21 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.92 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  26.86 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  28.54 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  28.54 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  26.48 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  25.99 
 
 		 448 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.48 
 
 		 473 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  27.31 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  26.86 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.61 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  29.28 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.16 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  28.41 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  28.6 
 
 		 476 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  27.04 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  26.91 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  28.85 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  28.84 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.87 
 
 		 465 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.38 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  26.48 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  29.45 
 
 		 602 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.29 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  28.24 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  24.14 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.28 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1671  FAD linked oxidase domain protein  28.34 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012602  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.48 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  34.91 
 
 		 458 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  25.55 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  34.98 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  25.9 
 
 		 465 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.14 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  35.35 
 
 		 465 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  24.89 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  27.25 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.14 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  23.79 
 
 		 705 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.45 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 		 466 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.29 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27 
 
 		 481 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  32.32 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.75 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  28.28 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  27.72 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 		 465 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 		 456 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.5 
 
 		 462 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  27.64 
 
 		 449 aa  96.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.51 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  26.92 
 
 		 596 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  33.49 
 
 		 752 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  27.98 
 
 		 470 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  23.37 
 
 		 473 aa  94  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.34 
 
 		 474 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.77 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.9 
 
 		 891 aa  90.1  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  28.7 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.68 
 
 		 734 aa  87.4  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 614 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 574 aa  87  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 477 aa  86.7  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  26.15 
 
 		 864 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  34.45 
 
 		 753 aa  86.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 864 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 864 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  27.75 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.88 
 
 		 726 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 		 896 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.91 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>