129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2207 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2207  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
456 aa  866    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  36.06 
 
 
462 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.06 
 
 
462 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.06 
 
 
462 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  36 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 
465 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  31.82 
 
 
467 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.72 
 
 
462 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.47 
 
 
436 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.37 
 
 
460 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  28.92 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  33.16 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  32.11 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.98 
 
 
473 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.11 
 
 
436 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  33.92 
 
 
470 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  30.48 
 
 
596 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  33.99 
 
 
468 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.23 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  31.28 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  31.92 
 
 
468 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 
479 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  37.28 
 
 
455 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.81 
 
 
444 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  30.67 
 
 
479 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  34.77 
 
 
439 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  27.43 
 
 
478 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  31.1 
 
 
463 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  29.67 
 
 
461 aa  100  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  33.96 
 
 
460 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.77 
 
 
473 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  33.16 
 
 
452 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  35.44 
 
 
441 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  42.07 
 
 
449 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.69 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  25.52 
 
 
461 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  28.81 
 
 
459 aa  90.5  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.3 
 
 
461 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.06 
 
 
478 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.57 
 
 
479 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.88 
 
 
472 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.47 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.07 
 
 
474 aa  84  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.74 
 
 
464 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  28.01 
 
 
479 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.19 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  28.62 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.69 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  23.49 
 
 
469 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  26.68 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  32.03 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  31.58 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  25.73 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.67 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  25.82 
 
 
477 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  34.39 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  27.81 
 
 
476 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.17 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  24.69 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  24.93 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.05 
 
 
891 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  30.14 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.86 
 
 
462 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  24.28 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  27.55 
 
 
466 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.26 
 
 
896 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  38.75 
 
 
458 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  26.04 
 
 
465 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.26 
 
 
705 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  29.11 
 
 
466 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  24.51 
 
 
602 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
864 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.48 
 
 
614 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.1 
 
 
466 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  25.71 
 
 
456 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
896 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
864 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  24.48 
 
 
864 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.14 
 
 
896 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31.47 
 
 
752 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.5 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.22 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  24.02 
 
 
894 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  24.37 
 
 
563 aa  61.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  29.62 
 
 
460 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  29.84 
 
 
463 aa  60.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.47 
 
 
469 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.87 
 
 
726 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  24.32 
 
 
473 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.44 
 
 
472 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  29.9 
 
 
454 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  22 
 
 
982 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03083  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02770)  26.11 
 
 
531 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315128  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 
532 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.4 
 
 
474 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.65 
 
 
574 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>