130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1990 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1990  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
424 aa  797    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
460 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.44 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  34.78 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  31.46 
 
 
462 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.46 
 
 
462 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.48 
 
 
462 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.16 
 
 
596 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.06 
 
 
473 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  34.3 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  33.62 
 
 
459 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  34.19 
 
 
455 aa  123  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  31.43 
 
 
449 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
754 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  26.62 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  30.66 
 
 
474 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.15 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  31.28 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.68 
 
 
469 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 
484 aa  86.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  28.46 
 
 
439 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  28.85 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  33.62 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.14 
 
 
436 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  31.9 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.29 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  27.39 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  25.26 
 
 
705 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  27.3 
 
 
753 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  27.5 
 
 
752 aa  70.5  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.79 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 
468 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  26.04 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  24.11 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  22.07 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  28.16 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  25.33 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.63 
 
 
726 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.89 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.53 
 
 
479 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.77 
 
 
499 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  29.82 
 
 
478 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  33 
 
 
460 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  26.62 
 
 
463 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  24.31 
 
 
456 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  26.81 
 
 
477 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
758 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  28.16 
 
 
459 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  24.81 
 
 
479 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.06 
 
 
461 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  36.08 
 
 
477 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  22.81 
 
 
461 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.85 
 
 
734 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  27.31 
 
 
465 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  22.73 
 
 
473 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.85 
 
 
478 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  24.15 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7168  berberine/berberine domain-containing protein  34.01 
 
 
149 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.094418  normal  0.11051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 
446 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.87 
 
 
456 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  25.85 
 
 
764 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  32.08 
 
 
460 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07075  conserved hypothetical protein  20.36 
 
 
486 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.307158  decreased coverage  0.00187387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.29 
 
 
458 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  29.46 
 
 
461 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  27.7 
 
 
461 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  23.87 
 
 
479 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  27.6 
 
 
602 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  22.89 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  22.69 
 
 
474 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 
462 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.91 
 
 
465 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07561  FAD linked oxidase, N-terminal  26.12 
 
 
428 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434173  hitchhiker  0.00617401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
480 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 
378 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12191  FAD linked oxidase, N-terminal  28.09 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.54 
 
 
461 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  24.43 
 
 
563 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  23 
 
 
501 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  21.88 
 
 
473 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03351  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 
581 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.66 
 
 
449 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.42 
 
 
466 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1811  hypothetical protein  32 
 
 
401 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.244893  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01310  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 
407 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.923813  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07091  FAD linked oxidase, N-terminal  24.38 
 
 
336 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.105041  normal  0.609294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  31.1 
 
 
466 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  28.22 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.09 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10392  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
497 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343544  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10402  FAD-binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03300)  25.58 
 
 
500 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0469697 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  25.36 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0085  FAD linked oxidase, N-terminal  23.75 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68983  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0844  hypothetical protein  31.2 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  32.14 
 
 
491 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  25.15 
 
 
775 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>