72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0844 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0844  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  801    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1811  hypothetical protein  57.82 
 
 
401 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.244893  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12191  FAD linked oxidase, N-terminal  47.41 
 
 
394 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07561  FAD linked oxidase, N-terminal  39.91 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.434173  hitchhiker  0.00617401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0085  FAD linked oxidase, N-terminal  41.37 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68983  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07011  FAD linked oxidase, N-terminal  37.6 
 
 
424 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.979719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07091  FAD linked oxidase, N-terminal  41.67 
 
 
336 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.105041  normal  0.609294 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0645  FAD linked oxidase, N-terminal  36.46 
 
 
425 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06721  FAD linked oxidase, N-terminal  35.86 
 
 
426 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07111  FAD linked oxidase, N-terminal  32.63 
 
 
426 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  24.23 
 
 
479 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  22.38 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  21.9 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  23.45 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  24.66 
 
 
461 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.19 
 
 
472 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  22.54 
 
 
474 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  22.52 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  22.86 
 
 
479 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  21.76 
 
 
463 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.84 
 
 
479 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  21.82 
 
 
471 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.11 
 
 
461 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.23 
 
 
461 aa  57  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  29.12 
 
 
563 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  23.55 
 
 
465 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.45 
 
 
448 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.07 
 
 
473 aa  53.1  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  23.89 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  23.36 
 
 
448 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05550  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 
482 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  23.81 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3416  berberine/berberine domain-containing protein  28.68 
 
 
202 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.68 
 
 
444 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  24.71 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  22.46 
 
 
705 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07269  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
542 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  24.75 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  25.14 
 
 
446 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1990  FAD linked oxidase domain protein  31.2 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  24.55 
 
 
456 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  30.84 
 
 
463 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  26.89 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.8 
 
 
436 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 
444 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 
864 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  32.71 
 
 
477 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.66 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 
864 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 
614 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.84 
 
 
462 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.71 
 
 
476 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
754 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.28 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  28.19 
 
 
864 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  23.35 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03351  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 
581 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  26.61 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  26.19 
 
 
462 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.28 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.83 
 
 
462 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.19 
 
 
462 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.74 
 
 
369 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  27.74 
 
 
369 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  26.36 
 
 
459 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  28.19 
 
 
459 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  25.31 
 
 
758 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10930  FAD-dependent oxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00840)  26.24 
 
 
501 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.304326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  23.46 
 
 
478 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>