More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5790 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
440 aa  899    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  57.5 
 
 
472 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  55.1 
 
 
444 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.71 
 
 
444 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  54.38 
 
 
442 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  45.96 
 
 
452 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.87 
 
 
433 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  46.03 
 
 
442 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  40.41 
 
 
443 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.22 
 
 
432 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  41.32 
 
 
430 aa  362  9e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  44.49 
 
 
433 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  41.04 
 
 
436 aa  340  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  43.11 
 
 
464 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  42.5 
 
 
432 aa  327  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.2 
 
 
454 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  39.91 
 
 
457 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  39.91 
 
 
457 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  41.61 
 
 
452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 
437 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.11 
 
 
462 aa  307  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  40.77 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.74 
 
 
433 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.49 
 
 
435 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.8 
 
 
437 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  40.98 
 
 
468 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 
432 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.65 
 
 
433 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  39.21 
 
 
438 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  39.78 
 
 
444 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  43.78 
 
 
438 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.32 
 
 
440 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.03 
 
 
453 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  43.16 
 
 
438 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.95 
 
 
447 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  37.78 
 
 
456 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 
456 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 
456 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  39.27 
 
 
436 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 
463 aa  276  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.33 
 
 
472 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  42.56 
 
 
438 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
455 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  36.32 
 
 
481 aa  262  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  37.99 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  33.84 
 
 
474 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.35 
 
 
425 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  34.05 
 
 
476 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.82 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  31.8 
 
 
431 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  31.57 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.34 
 
 
445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.62 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  23.81 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  30.72 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  30.72 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  23.15 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.43 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  31.93 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  31.09 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  31.09 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  31.09 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1591  twin-arginine translocation pathway signal  23.58 
 
 
497 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  31.09 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  31.09 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  20.85 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  31.09 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30.25 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  32.31 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  27.71 
 
 
432 aa  64.3  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 
490 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  29.41 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  32.62 
 
 
447 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  27.5 
 
 
436 aa  59.7  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  30.34 
 
 
761 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  29.37 
 
 
481 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  24.47 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  23.91 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 
484 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  26.89 
 
 
495 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  31.78 
 
 
474 aa  57  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.85 
 
 
474 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.81 
 
 
574 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.63 
 
 
474 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.85 
 
 
474 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 
474 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  29.85 
 
 
474 aa  54.3  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  24.74 
 
 
473 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  26.78 
 
 
457 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  27.32 
 
 
469 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  25 
 
 
578 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  27.69 
 
 
456 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  27.69 
 
 
460 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  28.78 
 
 
452 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.6 
 
 
473 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  31.58 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  29.46 
 
 
473 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  27.96 
 
 
471 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  25.2 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>