295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1064 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 441 aa  890    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  47.37 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.9 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  46.12 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  44.58 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.78 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  45.98 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  45.25 
 
 		 432 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  46.48 
 
 		 438 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  44.95 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.34 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  47.24 
 
 		 438 aa  315  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.31 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  41.27 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.61 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.04 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.71 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.58 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  38.05 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  38.85 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  38.89 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  40.36 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  35.14 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  37.75 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  37.82 
 
 		 440 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.31 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.05 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.12 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 		 457 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 		 457 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  40.11 
 
 		 472 aa  232  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  33.94 
 
 		 443 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  37.17 
 
 		 442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  39.53 
 
 		 462 aa  226  8e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  33.51 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  36.67 
 
 		 452 aa  222  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 		 476 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  35.7 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  32.54 
 
 		 474 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  33.92 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  33.75 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  35.99 
 
 		 432 aa  199  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.54 
 
 		 463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.66 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.65 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  32.65 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.65 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  33.5 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.36 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28.46 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.39 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.24 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.78 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30.82 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  30.82 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  30.82 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  30.61 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  30.82 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  30.82 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  27.81 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  30.61 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30.14 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  29.25 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  26.45 
 
 		 761 aa  63.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  31.91 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  30.23 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  28.28 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.52 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.34 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2316  FAD linked oxidase-like protein  29.66 
 
 		 1091 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0331253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.68 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  25.43 
 
 		 491 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  34.72 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  25.7 
 
 		 460 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  30.46 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  29.33 
 
 		 451 aa  53.5  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  31.08 
 
 		 452 aa  53.5  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.54 
 
 		 574 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  28.96 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  34.48 
 
 		 1018 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.48 
 
 		 1018 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.31 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.61 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.34 
 
 		 1023 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  27.21 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  25.9 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  28.57 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  25 
 
 		 499 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.37 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  25.45 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.76 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  29.19 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1806  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.34 
 
 		 496 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>