130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0897 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  83.11 
 
 
438 aa  729    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  89.5 
 
 
438 aa  784    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
438 aa  896    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.07 
 
 
440 aa  584  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  60.65 
 
 
438 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  52.08 
 
 
437 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.65 
 
 
447 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.48 
 
 
433 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  48.05 
 
 
432 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  47.52 
 
 
444 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.07 
 
 
435 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  46.79 
 
 
432 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.67 
 
 
433 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.38 
 
 
437 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  42.39 
 
 
443 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  43.97 
 
 
430 aa  346  4e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.43 
 
 
432 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  42.73 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  46.93 
 
 
436 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  45.13 
 
 
433 aa  330  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.99 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  42.03 
 
 
436 aa  327  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.48 
 
 
441 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  43.08 
 
 
444 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  43.37 
 
 
464 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  46.85 
 
 
442 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 
468 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  43.02 
 
 
440 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  39.69 
 
 
457 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  39.69 
 
 
457 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  42.36 
 
 
462 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.69 
 
 
444 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.5 
 
 
454 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  42.37 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  42.06 
 
 
472 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  42.97 
 
 
442 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  39.27 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.33 
 
 
453 aa  243  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  37.41 
 
 
455 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  38.64 
 
 
461 aa  239  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.67 
 
 
472 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  36.53 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  36.7 
 
 
456 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 
456 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 
456 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.65 
 
 
463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
474 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  31.95 
 
 
425 aa  220  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  33.78 
 
 
476 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  31.09 
 
 
431 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  30.83 
 
 
431 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 
445 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  27.47 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  27.57 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  30.3 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  27.85 
 
 
578 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  31.82 
 
 
436 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.64 
 
 
474 aa  56.6  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  28.67 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  28.19 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.21 
 
 
490 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.72 
 
 
456 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  26.47 
 
 
471 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  26.11 
 
 
478 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  27.21 
 
 
478 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.47 
 
 
478 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.47 
 
 
478 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  27.85 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  26.47 
 
 
478 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  26.47 
 
 
471 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.74 
 
 
468 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  25.74 
 
 
478 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  24.6 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  29.03 
 
 
457 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  20.88 
 
 
469 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  26.75 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  26.81 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  26.97 
 
 
425 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  28.08 
 
 
452 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24 
 
 
470 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  24.71 
 
 
437 aa  46.6  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  32.94 
 
 
978 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
999 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  24.58 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  30.84 
 
 
468 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001538  Fe-S oxidoreductase  24.24 
 
 
1015 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  25.7 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  26.78 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  23.16 
 
 
470 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  26.28 
 
 
1013 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  30.23 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.33 
 
 
978 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  28.47 
 
 
491 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.53 
 
 
973 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.35 
 
 
999 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.73 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  25.98 
 
 
1043 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>