255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1709 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  100 
 
 
432 aa  890    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.05 
 
 
433 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.66 
 
 
435 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.91 
 
 
433 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  52.78 
 
 
437 aa  435  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  50.23 
 
 
432 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  48.69 
 
 
436 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.44 
 
 
440 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.49 
 
 
447 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  46.21 
 
 
438 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.49 
 
 
437 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  48.99 
 
 
438 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  45.85 
 
 
438 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  43.09 
 
 
444 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  45.85 
 
 
438 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.77 
 
 
432 aa  319  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.09 
 
 
433 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  39.62 
 
 
443 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  41.9 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.28 
 
 
444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  40.77 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  38.55 
 
 
452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  37.24 
 
 
430 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  36.22 
 
 
436 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  41.54 
 
 
444 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  42.34 
 
 
432 aa  280  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  40.29 
 
 
457 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  41.31 
 
 
472 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  40.29 
 
 
457 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  39.9 
 
 
464 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  41.78 
 
 
442 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  40.77 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.7 
 
 
454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  38.52 
 
 
468 aa  272  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  38.48 
 
 
452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.27 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  40.41 
 
 
462 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  36.28 
 
 
481 aa  243  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.83 
 
 
453 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  36.83 
 
 
455 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  36.36 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.36 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.36 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  36.06 
 
 
461 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.54 
 
 
463 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.78 
 
 
472 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.68 
 
 
425 aa  219  6e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  31.26 
 
 
431 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  31.03 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  35.8 
 
 
476 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 
445 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  20.42 
 
 
468 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  20.71 
 
 
478 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  20.42 
 
 
478 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  20.71 
 
 
471 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  20.71 
 
 
478 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  20.47 
 
 
471 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  28.42 
 
 
478 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  19.86 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  19.63 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  26.35 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  28.89 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  28.74 
 
 
761 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  31.9 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  31.54 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  32.73 
 
 
473 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.85 
 
 
481 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  27.31 
 
 
436 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  30.06 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  28.11 
 
 
1043 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  30 
 
 
434 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  30.37 
 
 
437 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  29.21 
 
 
438 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  27.74 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1806  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
496 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
482 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  26.63 
 
 
452 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  26.35 
 
 
469 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  29.55 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.75 
 
 
488 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.06 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.75 
 
 
488 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.91 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  28.77 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.75 
 
 
488 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  25.78 
 
 
456 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  31.13 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  29.5 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  27.21 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.88 
 
 
482 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  31.37 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.06 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 
458 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  24.42 
 
 
578 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  25.77 
 
 
472 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.01 
 
 
497 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>