More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5088 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  933    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  83.26 
 
 
461 aa  781    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  84.21 
 
 
463 aa  795    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 
456 aa  933    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  933    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  86.75 
 
 
472 aa  824    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  64.96 
 
 
474 aa  611  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  67.4 
 
 
453 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  64.03 
 
 
476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  58.63 
 
 
481 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  50.22 
 
 
468 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.44 
 
 
454 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  46.34 
 
 
455 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  45.21 
 
 
452 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  43.24 
 
 
462 aa  333  4e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  36.9 
 
 
452 aa  299  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  39.82 
 
 
464 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.33 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  34.96 
 
 
443 aa  279  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  37.78 
 
 
440 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  36.1 
 
 
457 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  36.1 
 
 
457 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.78 
 
 
433 aa  269  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  37.56 
 
 
442 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 
472 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.18 
 
 
444 aa  259  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  34.95 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.02 
 
 
433 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  37.21 
 
 
436 aa  249  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  35.27 
 
 
444 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.33 
 
 
433 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  38.76 
 
 
432 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  38.11 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  36.36 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.96 
 
 
433 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  37.35 
 
 
437 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.89 
 
 
447 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.84 
 
 
435 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  37.47 
 
 
432 aa  216  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.65 
 
 
440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.12 
 
 
437 aa  213  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  34.01 
 
 
436 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 
425 aa  208  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  38.19 
 
 
438 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  33.87 
 
 
438 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  38.13 
 
 
438 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  34.3 
 
 
444 aa  203  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  38.04 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  29.78 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  28.67 
 
 
431 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 
441 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.29 
 
 
445 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  24.24 
 
 
478 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  24.06 
 
 
478 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  23.79 
 
 
471 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.19 
 
 
475 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.06 
 
 
478 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.01 
 
 
471 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.79 
 
 
478 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  23.81 
 
 
478 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  23.48 
 
 
478 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.59 
 
 
468 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  21.79 
 
 
481 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.96 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.8 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.22 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 
483 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  27.64 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  23.76 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  34.85 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
491 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.33 
 
 
1027 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.35 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.88 
 
 
461 aa  67  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.46 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  29.78 
 
 
474 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.81 
 
 
761 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  31.46 
 
 
474 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  30.9 
 
 
473 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.65 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 
485 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.63 
 
 
481 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  31.11 
 
 
499 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.78 
 
 
470 aa  63.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07269  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
474 aa  63.2  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.49 
 
 
482 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 
474 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  29.75 
 
 
471 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.45 
 
 
470 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.46 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.78 
 
 
474 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  28 
 
 
500 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  30.34 
 
 
474 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  27.98 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  31.67 
 
 
499 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  29.03 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>