289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4210 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 436 aa  882    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  48.69 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.08 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.76 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.18 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  49.5 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  47.07 
 
 		 432 aa  362  8e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.32 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.29 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  42.18 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  43.99 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.72 
 
 		 447 aa  312  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  46.93 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  46.52 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  46.9 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.95 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.39 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  43.4 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.59 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  39.27 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 		 443 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  40.52 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  40.27 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  41.69 
 
 		 444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  36.83 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  41.23 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  37.63 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  42.43 
 
 		 442 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  37.05 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  41.56 
 
 		 432 aa  256  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  39.57 
 
 		 442 aa  256  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.05 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  36 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  36 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  37.62 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  35.07 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.45 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 		 455 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  36.59 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  36.12 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  37.28 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  33.1 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  32.39 
 
 		 431 aa  213  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.01 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  34.01 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.01 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.53 
 
 		 472 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  35.57 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.27 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.29 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.54 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  32.35 
 
 		 475 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  31.58 
 
 		 478 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  30.41 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30.41 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  30.41 
 
 		 478 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  30.41 
 
 		 471 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  30.41 
 
 		 471 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  30.99 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  29.82 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.82 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  29.82 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  22.84 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.55 
 
 		 488 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  32.43 
 
 		 761 aa  67  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.98 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.98 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  26.11 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.05 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  30.1 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  26.78 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  25.5 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  25.79 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  30.05 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.25 
 
 		 470 aa  57  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  24.54 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  27.89 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.45 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  25 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.14 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  29.95 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  28 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  26.75 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.75 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  34.48 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  24.47 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  28.87 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  28.22 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28 
 
 		 459 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  29.41 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.43 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  34.48 
 
 		 437 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  34.48 
 
 		 437 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  35.42 
 
 		 437 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>