138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3785 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  81.51 
 
 		 438 aa  723    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  899    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  89.5 
 
 		 438 aa  752    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.7 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  59.49 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  51.95 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.53 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  50.25 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  47.22 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.56 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.08 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  45.85 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.87 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.06 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  43.4 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.26 
 
 		 432 aa  343  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  42 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  42.01 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  46.9 
 
 		 436 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.98 
 
 		 441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.23 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  41.79 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  43.17 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  43.11 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  42.07 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  43.16 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  43.84 
 
 		 442 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  40.64 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  38.55 
 
 		 457 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  38.55 
 
 		 457 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.86 
 
 		 462 aa  286  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.47 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  41.67 
 
 		 472 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  40.52 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  42.05 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.81 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  38.16 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  37.56 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.44 
 
 		 453 aa  246  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  38.23 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.6 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  37.34 
 
 		 481 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 		 425 aa  227  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  35.89 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  38.13 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  32.8 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  31.35 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  31.35 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  26.92 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  22.52 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  28.93 
 
 		 578 aa  66.6  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  23.42 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  30.81 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  23.1 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.08 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.52 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  26.39 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  23.41 
 
 		 478 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.39 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.39 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  26.39 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  27.22 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  26.49 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22.44 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.69 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  25.69 
 
 		 478 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  25.69 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 		 973 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  23.19 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  21.46 
 
 		 761 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  26.81 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  27.84 
 
 		 894 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.17 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  21.46 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.25 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  26.49 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  26.24 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.17 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  24.58 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  27.48 
 
 		 1013 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.46 
 
 		 461 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  29.51 
 
 		 978 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 999 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  26.54 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.67 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 		 978 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.7 
 
 		 983 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.96 
 
 		 999 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  26.77 
 
 		 1043 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0708  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.81 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  29.66 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>