More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1178 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  81.34 
 
 
461 aa  775    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  86.75 
 
 
456 aa  824    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.69 
 
 
463 aa  840    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
472 aa  965    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  86.75 
 
 
456 aa  824    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  86.75 
 
 
456 aa  824    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  66.81 
 
 
453 aa  608  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  62.58 
 
 
474 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  62.96 
 
 
476 aa  590  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  57.3 
 
 
481 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  47.75 
 
 
468 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.21 
 
 
454 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  44.77 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  44.79 
 
 
455 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  42.13 
 
 
462 aa  333  3e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  36.92 
 
 
452 aa  297  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  39.82 
 
 
464 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.53 
 
 
432 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  34.73 
 
 
443 aa  274  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 
440 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.31 
 
 
433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  36.87 
 
 
457 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  36.87 
 
 
457 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  36.53 
 
 
442 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  36.95 
 
 
472 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.92 
 
 
444 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  34.72 
 
 
430 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.16 
 
 
433 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  37.89 
 
 
432 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.28 
 
 
433 aa  242  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  36.53 
 
 
436 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  35.59 
 
 
444 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  36.78 
 
 
432 aa  232  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  36.97 
 
 
442 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.74 
 
 
447 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.64 
 
 
433 aa  229  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  36.6 
 
 
437 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  36.99 
 
 
432 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.02 
 
 
440 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  36 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  39.1 
 
 
438 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  35.53 
 
 
436 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  37.34 
 
 
438 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  39.1 
 
 
438 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.38 
 
 
437 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  33.95 
 
 
438 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  33.49 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  29.31 
 
 
425 aa  196  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  29.84 
 
 
431 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  28.95 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.36 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 
475 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  22.54 
 
 
478 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.15 
 
 
478 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  21.92 
 
 
471 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  22.13 
 
 
471 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.34 
 
 
478 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.27 
 
 
478 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  21.93 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.32 
 
 
490 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  21.09 
 
 
481 aa  80.1  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.7 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  24.07 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  23.04 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  36.67 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  30.57 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  33.06 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.32 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  34.18 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
481 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  22.48 
 
 
497 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  30.61 
 
 
761 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
457 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  25.21 
 
 
452 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.79 
 
 
479 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  25.17 
 
 
596 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  32.06 
 
 
456 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  28.98 
 
 
499 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  30.56 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  30.56 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.84 
 
 
1027 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  26.34 
 
 
496 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  25.06 
 
 
423 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 
491 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  29.53 
 
 
484 aa  60.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
481 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.08 
 
 
474 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8623  FAD linked oxidase domain protein  39.09 
 
 
1067 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  32.05 
 
 
471 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  29.76 
 
 
500 aa  60.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  25.78 
 
 
475 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
485 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  32.58 
 
 
474 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>