More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1893 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 481 aa  959    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  49.36 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.22 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  48.24 
 
 		 485 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.63 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  49.35 
 
 		 490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  51.01 
 
 		 503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  46.87 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  48.16 
 
 		 489 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  48.28 
 
 		 480 aa  438  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.35 
 
 		 493 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.4 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  47.84 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  47.84 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.92 
 
 		 497 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.72 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.59 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.9 
 
 		 890 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  46.98 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.57 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.56 
 
 		 485 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  46.2 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  47.29 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.35 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  46.5 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.28 
 
 		 497 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  47.87 
 
 		 509 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.35 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.1 
 
 		 887 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.86 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  46.28 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.86 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  47.2 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.28 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.78 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.69 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.65 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  45.98 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  47.45 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.64 
 
 		 482 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  45.34 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  45.04 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  47.32 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  45.26 
 
 		 499 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.69 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  45.77 
 
 		 499 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  45.12 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  44.4 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.65 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  45.36 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.88 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  46.22 
 
 		 499 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  45.55 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  45.55 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  43.51 
 
 		 492 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  46.21 
 
 		 499 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  45.34 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  45.55 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.07 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  45.65 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48 
 
 		 488 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.1 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  48.17 
 
 		 498 aa  412  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.51 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.04 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.18 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  44.4 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.32 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3342  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.11 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  44.18 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  44.18 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  45.32 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  44.18 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.53 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0331  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.32 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2754  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.22 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.7598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2601  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.32 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1192  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.11 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  45.11 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  43.75 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  46.97 
 
 		 487 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  47.39 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  47.1 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.47 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  44.4 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  43.75 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  45.83 
 
 		 477 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  45.31 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  48.01 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.88 
 
 		 488 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.3 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.38 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  45.54 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.25 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.68 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  46.54 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.6 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  44.69 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  47.43 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>