More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2496 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0293  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.12 
 
 		 500 aa  688    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  93.59 
 
 		 497 aa  957    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.75 
 
 		 497 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1170  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.25 
 
 		 529 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  76.75 
 
 		 497 aa  784    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  69.09 
 
 		 496 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  86.31 
 
 		 506 aa  835    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  76.75 
 
 		 497 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  74.07 
 
 		 504 aa  739    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  71.58 
 
 		 503 aa  706    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3342  glycolate oxidase, subunit GlcD  76.55 
 
 		 497 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0222  FAD linked oxidase domain protein  72.02 
 
 		 502 aa  701    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  75.15 
 
 		 497 aa  777    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0645  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.91 
 
 		 511 aa  697    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  98.8 
 
 		 497 aa  1004    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  77.15 
 
 		 497 aa  799    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.54 
 
 		 485 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  76.55 
 
 		 497 aa  781    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.69 
 
 		 511 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0606  FAD linked oxidase-like  72.61 
 
 		 492 aa  695    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0433  FAD linked oxidase-like  71.51 
 
 		 500 aa  691    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.15 
 
 		 497 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  76.95 
 
 		 497 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1781  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  76.13 
 
 		 501 aa  766    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2601  glycolate oxidase, subunit GlcD  76.75 
 
 		 497 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  85.6 
 
 		 500 aa  877    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  75.55 
 
 		 497 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0417  FAD linked oxidase domain protein  72.76 
 
 		 500 aa  701    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.589159  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1192  glycolate oxidase, subunit GlcD  76.55 
 
 		 497 aa  782    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.15 
 
 		 497 aa  774    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0331  glycolate oxidase, subunit GlcD  76.75 
 
 		 497 aa  784    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  77.64 
 
 		 501 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.55 
 
 		 497 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  73.65 
 
 		 494 aa  698    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.15 
 
 		 497 aa  774    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  69.98 
 
 		 501 aa  699    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1083  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.48 
 
 		 517 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 499 aa  1021    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  76.55 
 
 		 497 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3260  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.74 
 
 		 512 aa  710    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  61.62 
 
 		 499 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  59.32 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  61.54 
 
 		 499 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  61 
 
 		 499 aa  611  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  61.75 
 
 		 499 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  61.55 
 
 		 499 aa  611  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  61 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  60.79 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  60.58 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.96 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  62.21 
 
 		 499 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  62.61 
 
 		 498 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.54 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  61.38 
 
 		 499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  59.34 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.75 
 
 		 501 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  59.54 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  62.88 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  59.75 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  60.29 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  60.17 
 
 		 499 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  61.83 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  60.29 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  62.66 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  60.29 
 
 		 496 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  60.29 
 
 		 496 aa  596  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  59.87 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  60.08 
 
 		 496 aa  594  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  58.51 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  60.13 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  59.87 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  61.49 
 
 		 483 aa  589  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  59.13 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  59.34 
 
 		 499 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.7 
 
 		 490 aa  571  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  57.39 
 
 		 492 aa  566  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  57.02 
 
 		 497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.17 
 
 		 492 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  58.97 
 
 		 488 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.76 
 
 		 488 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  56.15 
 
 		 497 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.12 
 
 		 497 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.44 
 
 		 497 aa  555  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.01 
 
 		 502 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  55.94 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  55.17 
 
 		 497 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  55.11 
 
 		 497 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  55.58 
 
 		 497 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  53.1 
 
 		 498 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1899  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.56 
 
 		 496 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.11 
 
 		 498 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  52.9 
 
 		 498 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  53.11 
 
 		 498 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  53.65 
 
 		 497 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.87 
 
 		 479 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.11 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  50.11 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.89 
 
 		 479 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.02 
 
 		 486 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.55 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>