More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2684 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 480 aa  978    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  49.79 
 
 		 481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  47.77 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.37 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  49.34 
 
 		 486 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  49.01 
 
 		 509 aa  438  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  46.28 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.17 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.28 
 
 		 481 aa  438  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  47.39 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.9 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  46.02 
 
 		 489 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  47.17 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  47.17 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  48.52 
 
 		 483 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.71 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.7 
 
 		 485 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  44 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.47 
 
 		 488 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  46.02 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.2 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.9 
 
 		 482 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.69 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.84 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  44.98 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  45.65 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.07 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0660  putative glycolate oxidase subunit GlcD  45.63 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06971  putative glycolate oxidase subunit glcD  45.02 
 
 		 491 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.28 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.46 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.62 
 
 		 890 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  44.37 
 
 		 495 aa  405  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  44.97 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.48 
 
 		 887 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.31 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  43.13 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  42.25 
 
 		 497 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  41.83 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.65 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.14 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  44.35 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  44.92 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  43.9 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  42.37 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  41.23 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  43.28 
 
 		 498 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.42 
 
 		 486 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.07 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.26 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.79 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2754  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.37 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.7598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.92 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  44.44 
 
 		 497 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.13 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  44.03 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  43.46 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.79 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  41.4 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.67 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  41.98 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.02 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  43.58 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  42.57 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.74 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.04 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  44.4 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  42.57 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  42.67 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  43.14 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  41.4 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.51 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  42.67 
 
 		 496 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1362  FAD linked oxidase domain protein  45.78 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  42.54 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  42.73 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.16 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.33 
 
 		 497 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.76 
 
 		 492 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.07 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  42.57 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  42.73 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  42.67 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.69 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.9 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  40.64 
 
 		 503 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.94 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.9 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  40.64 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  41.91 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  42.76 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  41.42 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.56 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  41.03 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  40.86 
 
 		 499 aa  362  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.16 
 
 		 477 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.26 
 
 		 499 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0208  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.53 
 
 		 477 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  42.23 
 
 		 499 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.39 
 
 		 497 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>