More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2833 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  70.25 
 
 		 483 aa  721    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 484 aa  980    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  67.31 
 
 		 485 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  63.31 
 
 		 495 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.58 
 
 		 482 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  64.18 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.79 
 
 		 483 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  60.34 
 
 		 486 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  60.61 
 
 		 492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.91 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  59.96 
 
 		 495 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  59.96 
 
 		 495 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  60.17 
 
 		 494 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  60.55 
 
 		 485 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  59.56 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  61.18 
 
 		 490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.02 
 
 		 497 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.44 
 
 		 488 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  57.76 
 
 		 492 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.01 
 
 		 488 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.01 
 
 		 488 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  57.42 
 
 		 483 aa  525  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0660  putative glycolate oxidase subunit GlcD  57.46 
 
 		 483 aa  522  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.67 
 
 		 500 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  54.24 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.45 
 
 		 497 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06971  putative glycolate oxidase subunit glcD  57.21 
 
 		 491 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  53.39 
 
 		 497 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  54.09 
 
 		 497 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  52.72 
 
 		 481 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  54.09 
 
 		 497 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  54.76 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.81 
 
 		 497 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  53.55 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  52.26 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  51.66 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.45 
 
 		 497 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  54.53 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  52.29 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  52.54 
 
 		 495 aa  481  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  54.02 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  51.18 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  51.61 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  53.79 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  52.9 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  53.7 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.52 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  53.12 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  52.68 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  51.18 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  52.9 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  54.24 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  52.9 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.12 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  53.12 
 
 		 498 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  52.9 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  53.12 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  53.12 
 
 		 498 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  54.24 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  51.29 
 
 		 499 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  52.9 
 
 		 499 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  53.17 
 
 		 509 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.5 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  51.19 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  51.41 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  51.63 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  51.41 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  51.41 
 
 		 496 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.75 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  51.41 
 
 		 496 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  51.19 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1362  FAD linked oxidase domain protein  54.26 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  52.01 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  53.79 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  50.42 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.46 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  49.46 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  49.45 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  48.17 
 
 		 492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.89 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.93 
 
 		 500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.67 
 
 		 488 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.92 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1899  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.2 
 
 		 496 aa  445  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.92 
 
 		 479 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.17 
 
 		 492 aa  445  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  53.7 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  47.42 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2754  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.22 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.7598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0208  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.59 
 
 		 477 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  50.67 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.28 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.99 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1020  putative glycolate oxidase subunit protein  47.81 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0835602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.99 
 
 		 497 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2502  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.61 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.207618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2896  FAD-binding oxidoreductase/transferase  45.08 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  46.9 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2680  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.59 
 
 		 477 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  48.28 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>