176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0172 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  893    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  81.51 
 
 		 438 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  83.11 
 
 		 438 aa  706    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.99 
 
 		 440 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  60.14 
 
 		 438 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  51.73 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  51.75 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.26 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  49.88 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.87 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.83 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  46.15 
 
 		 432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.39 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.34 
 
 		 435 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  41.4 
 
 		 430 aa  339  7e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.78 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  40.9 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  46.9 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  40.32 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  46.84 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.24 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  43.78 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  39.9 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  43.58 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  45.43 
 
 		 442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  44.64 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.84 
 
 		 444 aa  293  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  41.67 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  38.25 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  38.25 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  43.75 
 
 		 472 aa  280  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.1 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  40.83 
 
 		 442 aa  264  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.28 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  42.03 
 
 		 432 aa  262  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  39.95 
 
 		 452 aa  253  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  38.76 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.95 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  39.05 
 
 		 461 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.1 
 
 		 472 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  38.23 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.23 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.23 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  36.18 
 
 		 474 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  35.75 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.34 
 
 		 463 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.4 
 
 		 425 aa  216  8e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  34.49 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  31.23 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  30.71 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.57 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  26.92 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29.81 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.01 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  24.94 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  31.9 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.84 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.94 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  26.47 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  27.21 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  25.66 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.47 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.47 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  23.46 
 
 		 469 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  24.3 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  25.74 
 
 		 478 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  27.1 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.74 
 
 		 468 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  25.74 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  25.74 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  28.48 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  26.11 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  21.7 
 
 		 761 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  30.05 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  26.52 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.97 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.12 
 
 		 470 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.23 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  25.19 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  28.49 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 		 983 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  27.08 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  29.23 
 
 		 1013 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.54 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1806  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  28.4 
 
 		 1052 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 974 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.47 
 
 		 474 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  27.74 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.73 
 
 		 978 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  26.09 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  26.04 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  27.98 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.45 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.52 
 
 		 469 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>