More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2832 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 424 aa  805    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  43.17 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  47.61 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  45.45 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  45.61 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.09 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.14 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.36 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  42.65 
 
 		 399 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  37.1 
 
 		 431 aa  223  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  36.56 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  31.68 
 
 		 437 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  32.51 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  33.66 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.48 
 
 		 437 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  36.52 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.24 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  35.77 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  38.32 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  32.24 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  50.21 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  50.21 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  49.79 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.07 
 
 		 379 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  34.49 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  32.14 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.77 
 
 		 887 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.4 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.19 
 
 		 876 aa  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  31.47 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  34.56 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  32.54 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  42.22 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  27.25 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  33.57 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  33 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  39.41 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.25 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.28 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.67 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.59 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.59 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.45 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  27.41 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.42 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  27.41 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.59 
 
 		 470 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.81 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.49 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.12 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.54 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  31.22 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.12 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.89 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.72 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  31.93 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.48 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  26.89 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  26.89 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.8 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.85 
 
 		 470 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.45 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  33.33 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.53 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.16 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.61 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.34 
 
 		 482 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  25.93 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.97 
 
 		 472 aa  133  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.41 
 
 		 890 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  25.91 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.66 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  33.06 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.73 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  40.21 
 
 		 601 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.81 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.57 
 
 		 461 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.66 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  30.31 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.31 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  32.99 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.77 
 
 		 358 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.71 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  42.16 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.02 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.01 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.02 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  28.84 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  30.71 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.71 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.39 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  40 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>