292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1740 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
462 aa  909    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.12 
 
 
454 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  45.17 
 
 
468 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  48.9 
 
 
455 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  48.55 
 
 
452 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.05 
 
 
463 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.13 
 
 
472 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.24 
 
 
456 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  43.24 
 
 
456 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.24 
 
 
456 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  41.35 
 
 
452 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  43.95 
 
 
481 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  43.2 
 
 
461 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.94 
 
 
453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.15 
 
 
433 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  42.86 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  44.93 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  41.11 
 
 
440 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  43.69 
 
 
472 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  41.36 
 
 
457 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  41.36 
 
 
457 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  43.21 
 
 
432 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.53 
 
 
444 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  38.57 
 
 
474 aa  296  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  37.16 
 
 
443 aa  296  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  39.9 
 
 
476 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  42.51 
 
 
444 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  35.76 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.09 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  40.8 
 
 
442 aa  281  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  33.95 
 
 
436 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  40.49 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  40.14 
 
 
438 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.26 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.84 
 
 
440 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.39 
 
 
433 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  40.41 
 
 
432 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  41.86 
 
 
438 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  41.13 
 
 
437 aa  262  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  39.71 
 
 
444 aa  262  8.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  42.93 
 
 
432 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  43.18 
 
 
438 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  41.47 
 
 
438 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.14 
 
 
425 aa  239  8e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  37.62 
 
 
436 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.91 
 
 
435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  32.43 
 
 
431 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  32.43 
 
 
431 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.53 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.67 
 
 
445 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  37.91 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 
441 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  30.11 
 
 
491 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  27.96 
 
 
478 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  27.96 
 
 
471 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  27.49 
 
 
471 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  29.69 
 
 
436 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  27.49 
 
 
478 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.49 
 
 
468 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.49 
 
 
478 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  27.61 
 
 
481 aa  60.5  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 
459 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.12 
 
 
462 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  25.29 
 
 
466 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.29 
 
 
466 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  30.12 
 
 
1000 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.77 
 
 
474 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.12 
 
 
989 aa  57.4  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  23.73 
 
 
478 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.84 
 
 
460 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.94 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  23.37 
 
 
478 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.5 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.5 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  27.63 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.09 
 
 
462 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.5 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 
470 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 
493 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 
461 aa  54.7  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 
467 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.29 
 
 
483 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  28.7 
 
 
500 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  26.44 
 
 
472 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.91 
 
 
474 aa  53.5  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.25 
 
 
459 aa  53.5  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.67 
 
 
488 aa  53.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  25.4 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.13 
 
 
472 aa  53.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  29.17 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  31.07 
 
 
473 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.39 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  25.22 
 
 
456 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.94 
 
 
477 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  25.86 
 
 
472 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>