More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1829 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
441 aa  881    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.86 
 
 
483 aa  339  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 
491 aa  289  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.77 
 
 
462 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  37.28 
 
 
378 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  27.6 
 
 
456 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  27.38 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  27.11 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.33 
 
 
461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  35.03 
 
 
479 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  35 
 
 
474 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  27.99 
 
 
473 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.51 
 
 
481 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  33.04 
 
 
462 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 
462 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  30.22 
 
 
461 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3126  FAD linked oxidase domain protein  41.14 
 
 
147 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  30.56 
 
 
475 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  34.44 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.06 
 
 
473 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.55 
 
 
479 aa  97.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  36.63 
 
 
477 aa  96.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  35.2 
 
 
478 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  26.64 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  32.8 
 
 
602 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.61 
 
 
464 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.15 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  35.94 
 
 
499 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  29.8 
 
 
461 aa  89.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  35.44 
 
 
465 aa  86.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  30 
 
 
705 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  29.09 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  37.99 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  25.26 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  24.66 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.26 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  26.3 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  32.96 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  35.09 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
490 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.88 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.74 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  31.36 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  25.26 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.71 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  32.14 
 
 
468 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.74 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  36.3 
 
 
464 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.74 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  36.21 
 
 
469 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  32.35 
 
 
477 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  29.38 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  32.49 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.63 
 
 
726 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  30.85 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.36 
 
 
484 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  31.69 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07075  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 
486 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.307158  decreased coverage  0.00187387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
753 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  28.07 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
754 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.94 
 
 
734 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
459 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  30.37 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  36.25 
 
 
446 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  24.23 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  32.62 
 
 
440 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  32.37 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
758 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  32.32 
 
 
761 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  32.06 
 
 
460 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.69 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  33.33 
 
 
752 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.6 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.75 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  31.21 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  34.15 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  36.13 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  26.9 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.32 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  31.89 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  31.94 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  32.43 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  36.21 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.77 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10392  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343544  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  34.67 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.63 
 
 
479 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.89 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  33.14 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.89 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.57 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.89 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  32.89 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>