More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4213 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 464 aa  937    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  41.48 
 
 		 452 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  43.11 
 
 		 440 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  48.56 
 
 		 472 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  41.49 
 
 		 457 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  41.49 
 
 		 457 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.08 
 
 		 454 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  42.51 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  40.4 
 
 		 433 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  42.04 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  40.18 
 
 		 468 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.79 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.53 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 		 456 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  39.82 
 
 		 456 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 		 456 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  40.71 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.61 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  40.62 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  42.7 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.25 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.39 
 
 		 453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  36.83 
 
 		 430 aa  282  8.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  43.11 
 
 		 438 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  39.91 
 
 		 436 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  44.64 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  39.9 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  42.55 
 
 		 432 aa  277  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  37.69 
 
 		 461 aa  276  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  39.19 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  43.37 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.84 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  38.56 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  36.4 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  34.63 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.8 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  36.27 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 		 432 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.03 
 
 		 433 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.08 
 
 		 433 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  37.56 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  38.89 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.24 
 
 		 447 aa  250  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28.26 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  29.11 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  30.47 
 
 		 431 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  31.95 
 
 		 475 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  24.67 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  35.09 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  32.52 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  32.52 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  32.52 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  32.26 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  32.52 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  31.71 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  25.77 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  31.45 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  31.71 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  26.62 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  26.02 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  30.65 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  23.52 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  30.25 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  27.92 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  33.17 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  27.59 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  30.51 
 
 		 761 aa  66.6  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  25.65 
 
 		 572 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 1023 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2316  FAD linked oxidase-like protein  38.1 
 
 		 1091 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0331253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  34.27 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.19 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.19 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.19 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  24.94 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  29.01 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.11 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7704  FAD linked oxidase  36.17 
 
 		 1017 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.14 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  32.37 
 
 		 1009 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  19.31 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.92 
 
 		 1023 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  33.92 
 
 		 1022 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  23.5 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.82 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  34.04 
 
 		 1018 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.04 
 
 		 1018 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0624  FAD linked oxidase-like protein  33.33 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.07 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.58 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>