86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1218 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
430 aa  874    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.08 
 
 
432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  51.27 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.22 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  47.14 
 
 
443 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  47.15 
 
 
436 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.8 
 
 
444 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  41.32 
 
 
440 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  41.86 
 
 
442 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  40.14 
 
 
442 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  41.55 
 
 
432 aa  343  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  38.91 
 
 
444 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  40.28 
 
 
438 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  38.5 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  39.13 
 
 
472 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.05 
 
 
440 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  43.4 
 
 
438 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  43.36 
 
 
438 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  41.4 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  37.92 
 
 
468 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  38.25 
 
 
437 aa  305  8.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.66 
 
 
433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  37.24 
 
 
432 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  36.38 
 
 
457 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  36.38 
 
 
457 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.53 
 
 
435 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.41 
 
 
433 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  38.7 
 
 
444 aa  285  8e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  35.76 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.6 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.29 
 
 
437 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  36.83 
 
 
464 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.2 
 
 
454 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  34.68 
 
 
452 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 
432 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  36.83 
 
 
436 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  34.61 
 
 
481 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  32.96 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.95 
 
 
456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.95 
 
 
456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  34.95 
 
 
456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.26 
 
 
453 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  36.07 
 
 
425 aa  251  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 
463 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  34.15 
 
 
461 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.72 
 
 
472 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  35.98 
 
 
474 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  36.32 
 
 
476 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.14 
 
 
441 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.03 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  28.46 
 
 
431 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  28.03 
 
 
431 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  24.5 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  24.25 
 
 
471 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.25 
 
 
478 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.25 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.73 
 
 
490 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.25 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  29.31 
 
 
478 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  28.45 
 
 
478 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  24.56 
 
 
475 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.18 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  28.45 
 
 
478 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  20.29 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  19.9 
 
 
469 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  19.8 
 
 
428 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.08 
 
 
574 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  29.05 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  24 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  25.22 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  21.05 
 
 
441 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.67 
 
 
474 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  28.46 
 
 
427 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  23.81 
 
 
481 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  20 
 
 
473 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  25.77 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  20 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  21.52 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  23.02 
 
 
578 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4140  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.41 
 
 
1017 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  23.36 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1806  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.92 
 
 
496 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8623  FAD linked oxidase domain protein  26.23 
 
 
1067 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  25.32 
 
 
554 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 
491 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  26.02 
 
 
452 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>