More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2163 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 442 aa  882    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.26 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  55.06 
 
 		 440 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  55.53 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  54.55 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.76 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  47.4 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  42.08 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  44.59 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.25 
 
 		 433 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  46.97 
 
 		 442 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  41.13 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  38.88 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  42.25 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  39.82 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  40.67 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.24 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  41.32 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.94 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  40.77 
 
 		 432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  42.3 
 
 		 437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.64 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  42.52 
 
 		 444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.45 
 
 		 447 aa  282  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.36 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.33 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  39.17 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  35.27 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  35.27 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  39.81 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.36 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.46 
 
 		 463 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  37.11 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  37.78 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  40.29 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  41.12 
 
 		 438 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 		 455 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  36.48 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  41.06 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  34.47 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  43.22 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.36 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  34.3 
 
 		 474 aa  226  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  32.47 
 
 		 476 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  30.84 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  30.68 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.01 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  33.61 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  33.61 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  33.61 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  33.61 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  32.54 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  32.79 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  32.54 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.12 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.15 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  29.94 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  30.95 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  31.15 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  21.98 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.71 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  21.55 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.75 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.87 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  29.36 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.23 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  30.23 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2316  FAD linked oxidase-like protein  31.5 
 
 		 1091 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0331253  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.87 
 
 		 1023 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1591  twin-arginine translocation pathway signal  31.19 
 
 		 497 aa  57  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  24 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.11 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.11 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.11 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.11 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.11 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.11 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.11 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.31 
 
 		 470 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.31 
 
 		 470 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  29.13 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 		 474 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.18 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.13 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  28.32 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1031 aa  54.7  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>