More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B3996 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  97.45 
 
 
470 aa  938    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  97.87 
 
 
470 aa  938    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  98.09 
 
 
470 aa  941    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  97.87 
 
 
470 aa  940    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  98.09 
 
 
470 aa  941    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  98.51 
 
 
470 aa  944    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  98.51 
 
 
470 aa  945    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  98.72 
 
 
470 aa  946    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  97.87 
 
 
470 aa  940    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  100 
 
 
470 aa  958    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  90.64 
 
 
470 aa  887    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  55.14 
 
 
457 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  55.24 
 
 
462 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  55.14 
 
 
457 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.14 
 
 
457 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  51.73 
 
 
462 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
461 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  50.44 
 
 
466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  53.65 
 
 
466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  50.43 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  48.91 
 
 
459 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  49.34 
 
 
459 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.33 
 
 
464 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  49.56 
 
 
461 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  49.02 
 
 
461 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.69 
 
 
459 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.77 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  49.89 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  49.46 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.35 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.23 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  47.38 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  46.72 
 
 
459 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.13 
 
 
459 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  45.85 
 
 
472 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  49.89 
 
 
459 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  46.09 
 
 
461 aa  423  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  45.41 
 
 
461 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.14 
 
 
462 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.25 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.57 
 
 
460 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.79 
 
 
460 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.57 
 
 
460 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.69 
 
 
459 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.09 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  43.82 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.58 
 
 
459 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.01 
 
 
459 aa  395  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.62 
 
 
460 aa  390  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  44.47 
 
 
456 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  44.1 
 
 
460 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  41.92 
 
 
483 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  43.06 
 
 
466 aa  356  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.57 
 
 
495 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.57 
 
 
495 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.57 
 
 
890 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  42.82 
 
 
466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  41.43 
 
 
474 aa  352  7e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.11 
 
 
758 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.13 
 
 
481 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.65 
 
 
484 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.02 
 
 
887 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  38.65 
 
 
481 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 
485 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.8 
 
 
471 aa  347  3e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  39.91 
 
 
489 aa  347  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 
479 aa  346  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  38.99 
 
 
490 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.91 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.44 
 
 
471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  39.56 
 
 
461 aa  343  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.07 
 
 
461 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 
493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  39.44 
 
 
470 aa  340  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.87 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 
461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.3 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.77 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.24 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  40.84 
 
 
498 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 
493 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.05 
 
 
496 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.96 
 
 
502 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 
475 aa  332  6e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  41.97 
 
 
462 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  40.09 
 
 
461 aa  332  9e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 
468 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  42.58 
 
 
455 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  39.77 
 
 
464 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.28 
 
 
492 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.12 
 
 
467 aa  332  1e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.31 
 
 
461 aa  331  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.57 
 
 
460 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  40.84 
 
 
455 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  39.33 
 
 
481 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 
462 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.2 
 
 
462 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.8 
 
 
497 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  39.49 
 
 
499 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  39.49 
 
 
499 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>