More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2139 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  74.56 
 
 
457 aa  678    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
475 aa  961    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0624  FAD linked oxidase-like protein  67.1 
 
 
482 aa  567  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  46.93 
 
 
472 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.11 
 
 
469 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  43.23 
 
 
466 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  43.05 
 
 
459 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.32 
 
 
459 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.37 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  44.01 
 
 
461 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  40.6 
 
 
456 aa  354  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  43.3 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.49 
 
 
464 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.08 
 
 
459 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  42.11 
 
 
459 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42.83 
 
 
466 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  42.07 
 
 
461 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.89 
 
 
459 aa  348  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.27 
 
 
459 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.38 
 
 
460 aa  348  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.16 
 
 
460 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.16 
 
 
460 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.17 
 
 
459 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.96 
 
 
460 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.83 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.81 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.44 
 
 
459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.11 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  42.95 
 
 
490 aa  336  5.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.78 
 
 
470 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.78 
 
 
470 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40 
 
 
461 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40 
 
 
470 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.78 
 
 
470 aa  333  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
470 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.78 
 
 
470 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.91 
 
 
470 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
470 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.26 
 
 
758 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  40.39 
 
 
483 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.79 
 
 
482 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.69 
 
 
460 aa  330  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.44 
 
 
464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.43 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.35 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.34 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.91 
 
 
470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.43 
 
 
461 aa  325  9e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.95 
 
 
488 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  41.23 
 
 
461 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.26 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.61 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  40.64 
 
 
499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  40.64 
 
 
499 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.58 
 
 
493 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.38 
 
 
484 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 
462 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.79 
 
 
481 aa  317  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.26 
 
 
499 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.31 
 
 
496 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.97 
 
 
493 aa  316  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  42.32 
 
 
498 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.78 
 
 
495 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.78 
 
 
495 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  39.87 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  41.32 
 
 
462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  42.96 
 
 
503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  40.48 
 
 
492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  41.1 
 
 
462 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  40.81 
 
 
499 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  39.91 
 
 
489 aa  313  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.4 
 
 
485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  39.17 
 
 
462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  37.56 
 
 
460 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.1 
 
 
462 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  41.39 
 
 
499 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.51 
 
 
501 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  41.23 
 
 
466 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.52 
 
 
503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0660  putative glycolate oxidase subunit GlcD  41 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  40.76 
 
 
497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.32 
 
 
499 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  40.7 
 
 
499 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  41.29 
 
 
499 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.91 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  41.2 
 
 
499 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  39.74 
 
 
499 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  41.46 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.66 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  43.04 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.43 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.45 
 
 
890 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  42.14 
 
 
499 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  39.39 
 
 
499 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
480 aa  307  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  41.48 
 
 
483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  40.18 
 
 
499 aa  306  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  39.78 
 
 
464 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06971  putative glycolate oxidase subunit glcD  41.09 
 
 
491 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.46 
 
 
488 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>