More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0346 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  84.57 
 
 		 460 aa  798    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  88.94 
 
 		 461 aa  846    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  70.43 
 
 		 461 aa  689    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  76.36 
 
 		 462 aa  719    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  74.35 
 
 		 461 aa  719    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 461 aa  941    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.7 
 
 		 460 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  50.55 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.3 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  52.61 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  52.19 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  50.55 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  50.77 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.33 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  48.69 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  48.69 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.91 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.69 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.69 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.69 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  48.47 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.03 
 
 		 470 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  48.47 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.25 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  48.25 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  49.46 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.25 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  44.44 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  43.82 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  44.49 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.07 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  43.57 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  43.67 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  43.79 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  43.45 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  43.71 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.02 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.98 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.05 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.48 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.79 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.79 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  40.91 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.93 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.1 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.98 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  41.43 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.08 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.61 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.11 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39 
 
 		 496 aa  350  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  39.39 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  42.58 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  38.6 
 
 		 499 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  39.25 
 
 		 499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  40.84 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  39.25 
 
 		 499 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  38.6 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  38.24 
 
 		 499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  38.9 
 
 		 499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  41.27 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  39.77 
 
 		 499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  38.72 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  37.58 
 
 		 499 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  37.8 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  39.08 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.36 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.73 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.69 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  36.84 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.89 
 
 		 486 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  39.03 
 
 		 499 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  38.32 
 
 		 499 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  37.94 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  36.92 
 
 		 489 aa  322  6e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.14 
 
 		 499 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  37.06 
 
 		 499 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  36.56 
 
 		 495 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  36.4 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.87 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  36.24 
 
 		 483 aa  319  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  37 
 
 		 481 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.44 
 
 		 501 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  38.11 
 
 		 499 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  38.11 
 
 		 499 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.7 
 
 		 495 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.7 
 
 		 495 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  36.95 
 
 		 499 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  37.88 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.14 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  38.83 
 
 		 479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  35.73 
 
 		 484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  39.25 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  38.1 
 
 		 499 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  38.1 
 
 		 499 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  38.11 
 
 		 499 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  36.77 
 
 		 485 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 		 471 aa  312  1e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>