More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0409 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
472 aa  954    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  47.6 
 
 
459 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  47.36 
 
 
459 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  48.35 
 
 
466 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  47.36 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.15 
 
 
464 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  47.14 
 
 
459 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.93 
 
 
464 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.47 
 
 
459 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.49 
 
 
459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  52.31 
 
 
466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  46.83 
 
 
461 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  48.91 
 
 
462 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  48.68 
 
 
466 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.67 
 
 
470 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.85 
 
 
470 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.05 
 
 
469 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.85 
 
 
470 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.32 
 
 
460 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.63 
 
 
470 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.85 
 
 
470 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.32 
 
 
460 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  45.41 
 
 
470 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  45.63 
 
 
470 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  45.85 
 
 
470 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  45.41 
 
 
470 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.32 
 
 
460 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  46.94 
 
 
461 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.93 
 
 
475 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.72 
 
 
460 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  44.69 
 
 
461 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.63 
 
 
470 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.02 
 
 
470 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  46.51 
 
 
457 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.73 
 
 
457 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.54 
 
 
460 aa  414  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  47.06 
 
 
462 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.2 
 
 
459 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.95 
 
 
462 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  44.62 
 
 
461 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  46.48 
 
 
457 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  46.19 
 
 
457 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.76 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  46.06 
 
 
456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  46.41 
 
 
462 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  45.97 
 
 
462 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  44.74 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.11 
 
 
459 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.49 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  43.67 
 
 
460 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  45.97 
 
 
462 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.37 
 
 
460 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  42.74 
 
 
474 aa  385  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  44.64 
 
 
461 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  42.14 
 
 
460 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.49 
 
 
461 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.37 
 
 
758 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  42.32 
 
 
461 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.27 
 
 
460 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  45.21 
 
 
481 aa  363  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  44.81 
 
 
459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0624  FAD linked oxidase-like protein  45.3 
 
 
482 aa  362  7.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.43 
 
 
468 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  42.42 
 
 
481 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.92 
 
 
890 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  43.45 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.67 
 
 
460 aa  356  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.24 
 
 
461 aa  356  5e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  42.64 
 
 
461 aa  356  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.18 
 
 
493 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 
483 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  40.52 
 
 
485 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.97 
 
 
475 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  41.09 
 
 
467 aa  351  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.48 
 
 
887 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.29 
 
 
457 aa  349  7e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  44.73 
 
 
455 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 
464 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.4 
 
 
471 aa  347  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  41.38 
 
 
474 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.41 
 
 
481 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  39.52 
 
 
499 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  40.74 
 
 
461 aa  346  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.3 
 
 
496 aa  345  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  41.98 
 
 
480 aa  346  7e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.82 
 
 
503 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 
473 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40 
 
 
501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.09 
 
 
493 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39.3 
 
 
499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  41.67 
 
 
456 aa  342  9e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.87 
 
 
467 aa  341  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  42.38 
 
 
503 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.26 
 
 
502 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.83 
 
 
478 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  39.82 
 
 
500 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.31 
 
 
466 aa  341  2e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.57 
 
 
497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.57 
 
 
497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>