More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0988 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 475 aa  975    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  69.31 
 
 		 466 aa  655    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  47.17 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.16 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.91 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  41.97 
 
 		 472 aa  352  8e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  39.4 
 
 		 474 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40.64 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.5 
 
 		 469 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  38.24 
 
 		 462 aa  316  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.05 
 
 		 466 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  38.38 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  36.88 
 
 		 456 aa  313  5.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.31 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.88 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  36.77 
 
 		 459 aa  309  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  36.56 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.77 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  35.62 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  35.62 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  35.36 
 
 		 462 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.62 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  36.3 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.62 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.8 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  36.25 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.84 
 
 		 470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.84 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.31 
 
 		 461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.84 
 
 		 470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.12 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.84 
 
 		 470 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  35.91 
 
 		 459 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.38 
 
 		 457 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.84 
 
 		 470 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  35.32 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  35.81 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  35.48 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.19 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.32 
 
 		 462 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  39.13 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.77 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  37.93 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.17 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  35.61 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 		 462 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  37.93 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  38.16 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 		 462 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.39 
 
 		 460 aa  293  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.01 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  38.6 
 
 		 459 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.42 
 
 		 462 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  37.01 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.03 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.13 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  37.01 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 		 475 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.87 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.05 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.58 
 
 		 463 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  36.58 
 
 		 463 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  36.58 
 
 		 463 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.53 
 
 		 488 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.01 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.79 
 
 		 469 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  34.68 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  37.56 
 
 		 452 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 		 469 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  39.05 
 
 		 455 aa  286  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 		 469 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  39.07 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  37.99 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.33 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.04 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.04 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  35.47 
 
 		 481 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  36.64 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  36.8 
 
 		 471 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.04 
 
 		 463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  36.15 
 
 		 463 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.03 
 
 		 460 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.33 
 
 		 459 aa  282  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.52 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.24 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.26 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  37.1 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.78 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  35.71 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.42 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.58 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  36.85 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.88 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.81 
 
 		 494 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.91 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.57 
 
 		 460 aa  280  5e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.57 
 
 		 460 aa  280  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.65 
 
 		 459 aa  279  9e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>