More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0708 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
460 aa  937    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  68.56 
 
 
459 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42.23 
 
 
466 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.1 
 
 
470 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.6 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  43.38 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  43.6 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.82 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.38 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.6 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  43.17 
 
 
470 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  43.17 
 
 
470 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.95 
 
 
470 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.38 
 
 
470 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  44.59 
 
 
481 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  42.14 
 
 
472 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  41.61 
 
 
461 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  43.17 
 
 
485 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.18 
 
 
464 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.01 
 
 
469 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.48 
 
 
459 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  41.92 
 
 
459 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  40.31 
 
 
461 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.38 
 
 
457 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  40.87 
 
 
466 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 
457 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40.48 
 
 
462 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.83 
 
 
466 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.61 
 
 
460 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.04 
 
 
457 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  40.6 
 
 
462 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 
462 aa  360  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 
460 aa  358  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.43 
 
 
493 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.95 
 
 
890 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.43 
 
 
461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.81 
 
 
887 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  37.55 
 
 
461 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  38.68 
 
 
490 aa  350  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 
459 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 
482 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.17 
 
 
459 aa  346  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.77 
 
 
493 aa  346  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 
459 aa  346  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 
483 aa  345  8e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.04 
 
 
464 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.04 
 
 
461 aa  341  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  40.62 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.6 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 
459 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  39.52 
 
 
461 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  40.32 
 
 
456 aa  336  5.999999999999999e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.6 
 
 
494 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.46 
 
 
495 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.46 
 
 
495 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  38.5 
 
 
480 aa  334  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.36 
 
 
460 aa  332  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  36.95 
 
 
499 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  38.11 
 
 
489 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  38.05 
 
 
483 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.58 
 
 
471 aa  330  3e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.33 
 
 
459 aa  330  3e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  36.5 
 
 
499 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.06 
 
 
488 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  36.73 
 
 
503 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.81 
 
 
496 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.81 
 
 
485 aa  325  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  37.28 
 
 
495 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  36.5 
 
 
499 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.06 
 
 
488 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.39 
 
 
462 aa  323  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.06 
 
 
492 aa  323  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.56 
 
 
457 aa  323  6e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  36.12 
 
 
497 aa  322  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.83 
 
 
488 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.14 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  36.14 
 
 
499 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  35.62 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.52 
 
 
497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.53 
 
 
481 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.73 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  37.74 
 
 
498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.34 
 
 
502 aa  319  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.92 
 
 
460 aa  319  6e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 
461 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.92 
 
 
460 aa  319  6e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  35.18 
 
 
499 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  36.97 
 
 
487 aa  319  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.36 
 
 
460 aa  319  7e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  39 
 
 
498 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  37 
 
 
492 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  35.84 
 
 
499 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.27 
 
 
466 aa  317  4e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.76 
 
 
497 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06971  putative glycolate oxidase subunit glcD  36.73 
 
 
491 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2754  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.79 
 
 
479 aa  315  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.7598  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.78 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.61 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0660  putative glycolate oxidase subunit GlcD  36.98 
 
 
483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.883034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>