More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1695 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  73.82 
 
 
498 aa  747    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  72.6 
 
 
498 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  71.57 
 
 
497 aa  726    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  72.8 
 
 
498 aa  735    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  74.03 
 
 
497 aa  767    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  73.42 
 
 
497 aa  755    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  71.92 
 
 
497 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  71.98 
 
 
497 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  70.55 
 
 
497 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
495 aa  1005    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  72.39 
 
 
498 aa  730    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  73.32 
 
 
502 aa  734    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1899  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  66.87 
 
 
496 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  72.51 
 
 
497 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  71.78 
 
 
497 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  58.82 
 
 
503 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.58 
 
 
496 aa  588  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  60.58 
 
 
499 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  60.58 
 
 
499 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  59.92 
 
 
499 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  59.75 
 
 
499 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  60.63 
 
 
499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  59.71 
 
 
499 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  61.57 
 
 
498 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  59.38 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  62.66 
 
 
499 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  60.49 
 
 
499 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  58.51 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  58.86 
 
 
499 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  58.94 
 
 
499 aa  571  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  58.86 
 
 
499 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  58.86 
 
 
496 aa  568  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  59.08 
 
 
499 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  59.75 
 
 
499 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  58.66 
 
 
499 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  59.06 
 
 
499 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  58.86 
 
 
499 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  58.86 
 
 
496 aa  568  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  60.43 
 
 
499 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  58.66 
 
 
496 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  59.92 
 
 
499 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  59.96 
 
 
499 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.54 
 
 
488 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  59.29 
 
 
499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  61.32 
 
 
488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.39 
 
 
486 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.4 
 
 
501 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  58.87 
 
 
499 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  59.5 
 
 
483 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  57.97 
 
 
504 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  60.7 
 
 
499 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  57.68 
 
 
484 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  58.11 
 
 
503 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.4 
 
 
497 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.71 
 
 
485 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.94 
 
 
499 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  56.56 
 
 
500 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.18 
 
 
500 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  55.37 
 
 
497 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.29 
 
 
477 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  55.86 
 
 
477 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.66 
 
 
497 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3260  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.94 
 
 
512 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  55.05 
 
 
492 aa  535  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.45 
 
 
497 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  54.1 
 
 
497 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  54 
 
 
497 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.05 
 
 
492 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  54.66 
 
 
497 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.3 
 
 
501 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  54 
 
 
497 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.66 
 
 
497 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.87 
 
 
497 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3342  glycolate oxidase, subunit GlcD  55.07 
 
 
497 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  54.24 
 
 
497 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4325  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.32 
 
 
477 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73889  normal  0.0799258 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  55.07 
 
 
497 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  55.58 
 
 
477 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0331  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.87 
 
 
497 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  53.72 
 
 
497 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  57.2 
 
 
501 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2601  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.87 
 
 
497 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  54.87 
 
 
497 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1192  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.66 
 
 
497 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.87 
 
 
497 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0293  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.76 
 
 
500 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0433  FAD linked oxidase-like  57.14 
 
 
500 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114577  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.91 
 
 
479 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  55.98 
 
 
496 aa  522  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1083  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.76 
 
 
517 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.3 
 
 
479 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.09 
 
 
479 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0606  FAD linked oxidase-like  56.73 
 
 
492 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.07 
 
 
497 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.05 
 
 
490 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1170  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.1 
 
 
529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.49 
 
 
506 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0690  FAD linked oxidase-like  53.13 
 
 
481 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.895548  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2896  FAD-binding oxidoreductase/transferase  53.49 
 
 
480 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0208  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.43 
 
 
477 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.23565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>