More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4382 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 459 aa  937    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  68.56 
 
 		 460 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  41.14 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.69 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.44 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  43.86 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.47 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.69 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  44.25 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  44.47 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  44.69 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  44.01 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.69 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  44.25 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  42.11 
 
 		 472 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.03 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.47 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.79 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.04 
 
 		 887 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  41.83 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  41.58 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  42.32 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  42.48 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  43.93 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  42.05 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.36 
 
 		 890 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  41.96 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  42.48 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  43.27 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  43.14 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  42.08 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.42 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.53 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.14 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.07 
 
 		 493 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.83 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  42.15 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  42.54 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.93 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  40.17 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.92 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.11 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.29 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  39.48 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.87 
 
 		 460 aa  372  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  41.28 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  41.45 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  41.07 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  42.16 
 
 		 489 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.61 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.57 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40.13 
 
 		 461 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  41.27 
 
 		 483 aa  362  9e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.67 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.18 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.05 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.44 
 
 		 460 aa  355  6.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.44 
 
 		 460 aa  355  6.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.62 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  39.07 
 
 		 499 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39.6 
 
 		 499 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  39.21 
 
 		 497 aa  350  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  40 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  40.42 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.27 
 
 		 475 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.85 
 
 		 497 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  38.85 
 
 		 499 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.72 
 
 		 497 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.74 
 
 		 484 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.35 
 
 		 492 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 		 495 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.32 
 
 		 494 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 		 495 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  39.23 
 
 		 498 aa  345  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.22 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  40.4 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  38.5 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  40.29 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  38.98 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  38.55 
 
 		 499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.34 
 
 		 496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  41.65 
 
 		 499 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  41.16 
 
 		 499 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  38.77 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.43 
 
 		 462 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  38.28 
 
 		 495 aa  343  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  39.74 
 
 		 498 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.94 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  38.33 
 
 		 499 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.68 
 
 		 499 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.27 
 
 		 488 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  38.11 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.18 
 
 		 497 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  40.88 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  38.33 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  38.44 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  38.05 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  38.24 
 
 		 477 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>