More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1226 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  70 
 
 
460 aa  673    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  100 
 
 
460 aa  936    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  84.13 
 
 
460 aa  776    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  67.99 
 
 
461 aa  661    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  99.35 
 
 
460 aa  929    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  71.74 
 
 
459 aa  681    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  100 
 
 
460 aa  936    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  72.39 
 
 
459 aa  706    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  47.57 
 
 
459 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  46.67 
 
 
459 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.25 
 
 
469 aa  428  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  44.32 
 
 
472 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  46.67 
 
 
466 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  45.58 
 
 
459 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  45.35 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.35 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.15 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.24 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.57 
 
 
470 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.98 
 
 
459 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  43.36 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  43.36 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  43.36 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.36 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.92 
 
 
470 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  43.14 
 
 
470 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.92 
 
 
470 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  42.57 
 
 
461 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.92 
 
 
470 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.14 
 
 
470 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.86 
 
 
462 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  42.39 
 
 
461 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.24 
 
 
460 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.39 
 
 
457 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  42.35 
 
 
461 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  41.52 
 
 
462 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  39.43 
 
 
466 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.91 
 
 
464 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.09 
 
 
457 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  42.35 
 
 
462 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.91 
 
 
460 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.79 
 
 
461 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 
462 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  39 
 
 
457 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  41.14 
 
 
456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.44 
 
 
459 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.11 
 
 
461 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  40.13 
 
 
461 aa  353  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  40.92 
 
 
462 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 
462 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 
462 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.16 
 
 
475 aa  345  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  39.91 
 
 
460 aa  342  9e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 
457 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 
466 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 
468 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  39.05 
 
 
464 aa  340  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  40.17 
 
 
467 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  37.99 
 
 
464 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.53 
 
 
474 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.16 
 
 
469 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  40.48 
 
 
458 aa  327  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.33 
 
 
471 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 
481 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  36.96 
 
 
483 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  40.17 
 
 
470 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
455 aa  322  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.05 
 
 
460 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  37.92 
 
 
460 aa  319  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  39.69 
 
 
461 aa  319  7e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  39.17 
 
 
459 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.87 
 
 
890 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.63 
 
 
887 aa  317  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  39.77 
 
 
461 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.25 
 
 
493 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  35.46 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.47 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  36.04 
 
 
485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.3 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  39.6 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.42 
 
 
478 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  38.9 
 
 
455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  36.34 
 
 
490 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.2 
 
 
457 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  39.37 
 
 
466 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  38 
 
 
493 aa  312  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  37.56 
 
 
498 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.65 
 
 
473 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  36.73 
 
 
461 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.76 
 
 
496 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  36.36 
 
 
474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.28 
 
 
493 aa  306  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  36.57 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.52 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.37 
 
 
460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.95 
 
 
466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  37.77 
 
 
479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.93 
 
 
482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.81 
 
 
453 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  37.92 
 
 
461 aa  302  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>