More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1219 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  82.03 
 
 		 471 aa  780    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 466 aa  925    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.02 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.02 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.45 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  45.79 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  45.79 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  46 
 
 		 481 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  43.72 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.7 
 
 		 492 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  43.72 
 
 		 492 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.47 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  45.99 
 
 		 509 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.04 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  43.91 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.57 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.72 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.77 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.72 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.72 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  43.63 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.64 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  44.9 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  42.55 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  44.32 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.88 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.99 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  44.44 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  43.41 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  43.41 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  40.69 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  43.2 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.04 
 
 		 890 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.71 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  42.55 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  43.65 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.77 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.53 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.85 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  42.98 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.93 
 
 		 887 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  42.42 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.48 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  43.88 
 
 		 499 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  41.34 
 
 		 497 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  42.55 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  46.1 
 
 		 487 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  41.34 
 
 		 497 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  41.74 
 
 		 497 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  43.21 
 
 		 499 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2754  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.99 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.7598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  44.55 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  42.12 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.07 
 
 		 482 aa  360  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  42.98 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  42.98 
 
 		 499 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  43.2 
 
 		 484 aa  359  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1899  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.86 
 
 		 496 aa  359  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  42.46 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.61 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.23 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  42.09 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  42.98 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  41.47 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  43.74 
 
 		 495 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  42.54 
 
 		 499 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.12 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.86 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.87 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.24 
 
 		 477 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.02 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.08 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.08 
 
 		 498 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  41.87 
 
 		 497 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.87 
 
 		 497 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.74 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.55 
 
 		 483 aa  353  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  42.57 
 
 		 498 aa  353  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.43 
 
 		 497 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.43 
 
 		 497 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.86 
 
 		 498 aa  352  8e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  42.21 
 
 		 482 aa  352  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  45.77 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0660  putative glycolate oxidase subunit GlcD  40.34 
 
 		 483 aa  352  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  41.33 
 
 		 483 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  41.43 
 
 		 497 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  42.98 
 
 		 500 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.04 
 
 		 484 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.07 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.34 
 
 		 479 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.47 
 
 		 457 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.39 
 
 		 488 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  42.76 
 
 		 499 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.44 
 
 		 498 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4325  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.87 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73889  normal  0.0799258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.54 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.87 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  41.04 
 
 		 499 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  41.04 
 
 		 499 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>