More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1623 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  100 
 
 		 457 aa  930    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.56 
 
 		 457 aa  732    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  80.31 
 
 		 462 aa  761    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  80.96 
 
 		 457 aa  767    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  57.11 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  55.14 
 
 		 470 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  55.14 
 
 		 470 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  55.14 
 
 		 470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  55.14 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.92 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  54.92 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  54.92 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  54.92 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  55.14 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.92 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  53.19 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  52.75 
 
 		 460 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  51.43 
 
 		 461 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  52.88 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  52.1 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  50.11 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.56 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.76 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.55 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  46.7 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.12 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  48.01 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  47.48 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  46.17 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  46.17 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  46.51 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  46.39 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  45.3 
 
 		 459 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.17 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.46 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.87 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.59 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  42.89 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  41 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.48 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.61 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.35 
 
 		 462 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  47.67 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.39 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.39 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.53 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.52 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  44.47 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.52 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  39.38 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  43.83 
 
 		 461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.85 
 
 		 486 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.77 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  40.13 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.87 
 
 		 482 aa  346  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.33 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.33 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.44 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.59 
 
 		 492 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.47 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  38.67 
 
 		 490 aa  343  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.07 
 
 		 497 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 		 485 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  37.22 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.29 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.08 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  41.7 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  40.55 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  40.66 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.52 
 
 		 471 aa  330  4e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.61 
 
 		 483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  41.12 
 
 		 498 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 		 461 aa  329  6e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  39.7 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  38.5 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.76 
 
 		 485 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.83 
 
 		 758 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  35.68 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.08 
 
 		 890 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  40.96 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  37.31 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37 
 
 		 497 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  38.75 
 
 		 464 aa  324  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  36.64 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.94 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  37.64 
 
 		 497 aa  323  6e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.5 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  38.5 
 
 		 499 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  41.92 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.44 
 
 		 498 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.44 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.14 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  37.31 
 
 		 495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 		 493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  38.94 
 
 		 484 aa  319  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  36.42 
 
 		 497 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.91 
 
 		 488 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.22 
 
 		 887 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>