More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0525 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
456 aa  916    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.2 
 
 
469 aa  490  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  45.6 
 
 
459 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  44.57 
 
 
466 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  45.6 
 
 
459 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  46.06 
 
 
472 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 
459 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.25 
 
 
464 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.05 
 
 
470 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  42.27 
 
 
461 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  44.59 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  44.59 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.47 
 
 
470 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.47 
 
 
470 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.19 
 
 
464 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.24 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  44.47 
 
 
470 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  44.37 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.47 
 
 
470 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.37 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.67 
 
 
460 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.59 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  42.2 
 
 
461 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.34 
 
 
459 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40.75 
 
 
466 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.11 
 
 
459 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  44.47 
 
 
457 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.74 
 
 
459 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  43.32 
 
 
461 aa  368  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  42.14 
 
 
466 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  43.88 
 
 
462 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  43.65 
 
 
457 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  41.19 
 
 
461 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 
457 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 
460 aa  362  6e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  43.19 
 
 
462 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.71 
 
 
461 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  40.13 
 
 
461 aa  359  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.14 
 
 
460 aa  358  9e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.14 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.14 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.69 
 
 
475 aa  356  5e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.79 
 
 
462 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  38.38 
 
 
457 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.47 
 
 
459 aa  354  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  41.23 
 
 
462 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.02 
 
 
460 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.56 
 
 
459 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.73 
 
 
758 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  38.91 
 
 
461 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  43.02 
 
 
474 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  39.91 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.23 
 
 
461 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 
460 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  39.26 
 
 
460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.43 
 
 
462 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  41.08 
 
 
481 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.94 
 
 
457 aa  339  7e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  39.1 
 
 
464 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.69 
 
 
495 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.69 
 
 
495 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.38 
 
 
493 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.49 
 
 
469 aa  335  9e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  41.14 
 
 
460 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.09 
 
 
478 aa  333  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  39.45 
 
 
481 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  40.71 
 
 
462 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  40.46 
 
 
485 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  40.95 
 
 
462 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  40.52 
 
 
509 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  39.59 
 
 
498 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.91 
 
 
494 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  40.55 
 
 
467 aa  329  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  39.25 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  39.25 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  39.17 
 
 
455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  37.73 
 
 
464 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  39.52 
 
 
483 aa  325  9e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.27 
 
 
473 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.94 
 
 
493 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.82 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  38.22 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.31 
 
 
471 aa  318  1e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.42 
 
 
481 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 
479 aa  317  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0624  FAD linked oxidase-like protein  38.37 
 
 
482 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.25 
 
 
488 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.25 
 
 
488 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.91 
 
 
492 aa  316  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  40.05 
 
 
499 aa  315  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  38.25 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  38.16 
 
 
499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  38.2 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  38.33 
 
 
499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  36.44 
 
 
483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  38.69 
 
 
455 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.98 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  38.82 
 
 
499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.3 
 
 
471 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>