More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0352 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 469 aa  954    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  65.07 
 
 		 461 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  64.98 
 
 		 467 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  62.3 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  53.46 
 
 		 483 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.97 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  54.65 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.55 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  48.79 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  49.78 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  50.22 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  48.92 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  48.92 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.78 
 
 		 473 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.28 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  42.44 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  42.51 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.6 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  42.07 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.68 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.85 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.74 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40.27 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.54 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 		 459 aa  359  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  39.49 
 
 		 456 aa  353  4e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.38 
 
 		 460 aa  349  5e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.16 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.16 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.11 
 
 		 461 aa  347  4e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  39.3 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.15 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.84 
 
 		 459 aa  338  9e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.44 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  37.67 
 
 		 460 aa  329  6e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  38.99 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.9 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  37.69 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.06 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.37 
 
 		 470 aa  322  8e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  38.84 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  38.51 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  39.06 
 
 		 462 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.24 
 
 		 470 aa  320  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  36.92 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.65 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.72 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.72 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.92 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.93 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.93 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.93 
 
 		 470 aa  317  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.44 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.93 
 
 		 470 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.91 
 
 		 466 aa  316  7e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  34.5 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  34.5 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.48 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.7 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.8 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  36.04 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.34 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  41.49 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 460 aa  309  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  35.6 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  36.11 
 
 		 483 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  37.47 
 
 		 483 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.7 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  35.4 
 
 		 474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  36.24 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  37.7 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.6 
 
 		 758 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.58 
 
 		 471 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.12 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.11 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.34 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  36.67 
 
 		 503 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  39.25 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.82 
 
 		 493 aa  300  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  36.56 
 
 		 484 aa  299  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  38.66 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  41.71 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  35.82 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  35.51 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.76 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  36.04 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.26 
 
 		 497 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.99 
 
 		 497 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.35 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  36.26 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  39.68 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.1 
 
 		 488 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  34.07 
 
 		 462 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.7 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  37.39 
 
 		 474 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.95 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  35.13 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>