More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2013 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
464 aa  938    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.29 
 
 
471 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  50.21 
 
 
474 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  50 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0882  FAD linked oxidase domain protein  47.94 
 
 
473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.47 
 
 
464 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.64 
 
 
462 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.19 
 
 
459 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  41.49 
 
 
461 aa  359  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  39.73 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.4 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.39 
 
 
460 aa  353  5e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  39.69 
 
 
459 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  39.69 
 
 
459 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.82 
 
 
459 aa  348  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.79 
 
 
459 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
470 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.26 
 
 
460 aa  340  4e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.05 
 
 
460 aa  340  5e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.05 
 
 
460 aa  340  5e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  40.27 
 
 
472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.77 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.77 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40 
 
 
470 aa  336  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.77 
 
 
470 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.77 
 
 
470 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.77 
 
 
470 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
470 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.84 
 
 
459 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.53 
 
 
470 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.77 
 
 
470 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.53 
 
 
470 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.79 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.6 
 
 
459 aa  327  3e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  37.73 
 
 
456 aa  325  7e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  41.96 
 
 
461 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.75 
 
 
457 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 
470 aa  323  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.44 
 
 
464 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  42.64 
 
 
462 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 
462 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  37.64 
 
 
460 aa  318  9e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  39.81 
 
 
461 aa  318  9e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 
462 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.33 
 
 
460 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.69 
 
 
461 aa  317  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.35 
 
 
478 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.82 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  41.38 
 
 
481 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  39.39 
 
 
464 aa  313  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 
457 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37.94 
 
 
466 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  36.7 
 
 
462 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  38.7 
 
 
462 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.85 
 
 
457 aa  309  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  41.1 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.98 
 
 
464 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.63 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.04 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  36.7 
 
 
461 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  40.27 
 
 
455 aa  303  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  38.13 
 
 
466 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.47 
 
 
460 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  37.26 
 
 
460 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  38.11 
 
 
467 aa  299  8e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.97 
 
 
460 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.18 
 
 
466 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.11 
 
 
460 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.76 
 
 
461 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  35.73 
 
 
466 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  39.82 
 
 
461 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  39.64 
 
 
461 aa  293  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  40.65 
 
 
460 aa  292  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.48 
 
 
457 aa  292  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 
462 aa  289  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  40.82 
 
 
459 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.7 
 
 
469 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  43.36 
 
 
441 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.66 
 
 
473 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.27 
 
 
887 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  37.86 
 
 
483 aa  286  5.999999999999999e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.27 
 
 
890 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  37.41 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 
456 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.02 
 
 
481 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.58 
 
 
461 aa  280  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  39.43 
 
 
479 aa  280  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.24 
 
 
486 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  38.07 
 
 
461 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.47 
 
 
461 aa  279  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  35.76 
 
 
474 aa  277  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  36.75 
 
 
461 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.03 
 
 
461 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  36.75 
 
 
461 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  40.91 
 
 
455 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.82 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.31 
 
 
495 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.97 
 
 
495 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>