More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3296 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  952    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.78 
 
 
469 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  49.78 
 
 
461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  47.01 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  49.54 
 
 
467 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  45.92 
 
 
483 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  49.46 
 
 
461 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.51 
 
 
478 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.26 
 
 
459 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  47.02 
 
 
461 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  42.26 
 
 
459 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  44.98 
 
 
462 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  47.02 
 
 
461 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  45.26 
 
 
462 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  46.41 
 
 
461 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  45.83 
 
 
460 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  42.04 
 
 
461 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  45.47 
 
 
462 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  48.37 
 
 
461 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.29 
 
 
461 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.49 
 
 
461 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 
466 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.81 
 
 
459 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.37 
 
 
459 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  41.15 
 
 
459 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.06 
 
 
462 aa  362  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 
464 aa  360  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  41.63 
 
 
472 aa  358  9e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.93 
 
 
459 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.81 
 
 
469 aa  345  8e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.86 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.39 
 
 
461 aa  338  9e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  37.27 
 
 
456 aa  336  5e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  37.95 
 
 
470 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.95 
 
 
470 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  41.38 
 
 
481 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.95 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  37.5 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.73 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.5 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.5 
 
 
470 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.17 
 
 
459 aa  329  8e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.73 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  37.27 
 
 
470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  37.27 
 
 
470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.12 
 
 
460 aa  327  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.73 
 
 
459 aa  326  5e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.65 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.65 
 
 
460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.65 
 
 
460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.63 
 
 
460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.53 
 
 
460 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.4 
 
 
459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 
461 aa  312  9e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  37.28 
 
 
461 aa  312  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  43.07 
 
 
461 aa  312  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  41.98 
 
 
455 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  38.02 
 
 
457 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  37.99 
 
 
466 aa  309  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  42.58 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  37.72 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.61 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  36.68 
 
 
462 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  35.56 
 
 
460 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.45 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  40.62 
 
 
457 aa  302  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.72 
 
 
457 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
479 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.98 
 
 
464 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.23 
 
 
460 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  38.66 
 
 
464 aa  299  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.07 
 
 
471 aa  299  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37 
 
 
466 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.23 
 
 
460 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.11 
 
 
457 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.91 
 
 
474 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.48 
 
 
458 aa  296  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.56 
 
 
460 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.95 
 
 
890 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 
462 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  35.01 
 
 
460 aa  292  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.74 
 
 
461 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  39.09 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 
481 aa  290  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  39.56 
 
 
459 aa  289  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.44 
 
 
464 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.79 
 
 
457 aa  289  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.38 
 
 
456 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 
486 aa  286  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.63 
 
 
453 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  39.29 
 
 
458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  35.09 
 
 
461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 
887 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  38.64 
 
 
456 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  43.03 
 
 
441 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  36.12 
 
 
480 aa  280  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  34.79 
 
 
474 aa  279  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 
483 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.12 
 
 
476 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>