More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3899 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 470 aa  944    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.03 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.63 
 
 		 460 aa  465  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.78 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  43.74 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  43.11 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.65 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.23 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  42.01 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.1 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.58 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.2 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  41.28 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  41.81 
 
 		 464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.27 
 
 		 459 aa  356  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  39.69 
 
 		 461 aa  356  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.26 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  43.42 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  43.08 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  42.63 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 		 462 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.39 
 
 		 470 aa  346  7e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.39 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.17 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.39 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.82 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.17 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.42 
 
 		 470 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  38.95 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  38.95 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.22 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.52 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.52 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.52 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.95 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.18 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  40.88 
 
 		 460 aa  335  9e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  41.13 
 
 		 466 aa  333  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  42.42 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  41.32 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  41.32 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.74 
 
 		 459 aa  329  8e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.6 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  40.57 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.29 
 
 		 457 aa  326  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.6 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40.95 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  40.73 
 
 		 464 aa  323  6e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.45 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  42.48 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.02 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  44.1 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.39 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.18 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38.52 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.61 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.44 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.61 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  40.92 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  37.61 
 
 		 466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  40.44 
 
 		 474 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.83 
 
 		 461 aa  312  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  39.67 
 
 		 462 aa  312  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.34 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  40.93 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  38.86 
 
 		 485 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 		 483 aa  310  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.08 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  39.04 
 
 		 460 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.86 
 
 		 493 aa  308  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  38.33 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.75 
 
 		 459 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.51 
 
 		 887 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  40.45 
 
 		 467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.29 
 
 		 890 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.46 
 
 		 472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.12 
 
 		 462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.42 
 
 		 493 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.37 
 
 		 478 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.81 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.78 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  41.61 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.86 
 
 		 495 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.82 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.73 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.15 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.86 
 
 		 495 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.21 
 
 		 503 aa  297  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0882  FAD linked oxidase domain protein  39.26 
 
 		 473 aa  295  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.13 
 
 		 457 aa  295  8e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  38.19 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>