More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1466 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
458 aa  927    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.71 
 
 
464 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.79 
 
 
462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  41.37 
 
 
459 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.56 
 
 
469 aa  352  8e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.58 
 
 
459 aa  348  8e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  39.56 
 
 
466 aa  348  8e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40.58 
 
 
461 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.7 
 
 
460 aa  346  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.48 
 
 
460 aa  345  7e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.48 
 
 
460 aa  345  7e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.08 
 
 
460 aa  345  7e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  40.13 
 
 
459 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  39.91 
 
 
459 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  41.1 
 
 
472 aa  338  9e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 
459 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.56 
 
 
459 aa  336  5e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.28 
 
 
461 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  39.69 
 
 
461 aa  334  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  41.1 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  42.62 
 
 
462 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  39.76 
 
 
456 aa  323  3e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  42.38 
 
 
462 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.18 
 
 
459 aa  322  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  42.38 
 
 
462 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.19 
 
 
459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.7 
 
 
457 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  38.27 
 
 
464 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.74 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.77 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  42.27 
 
 
474 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  40.61 
 
 
479 aa  313  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 
466 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.06 
 
 
471 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  38.89 
 
 
460 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.31 
 
 
460 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  41.47 
 
 
481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.05 
 
 
461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.86 
 
 
470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  39.55 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.91 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  39.55 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  39.51 
 
 
460 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 
461 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  41.48 
 
 
461 aa  302  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.86 
 
 
470 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 
461 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  37.86 
 
 
470 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  37.68 
 
 
466 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.86 
 
 
470 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  37.62 
 
 
470 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.62 
 
 
470 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37.83 
 
 
462 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.62 
 
 
470 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  37.62 
 
 
470 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  37.62 
 
 
470 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  41.96 
 
 
461 aa  300  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  42.48 
 
 
455 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.78 
 
 
460 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.38 
 
 
470 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.62 
 
 
470 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.61 
 
 
493 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.84 
 
 
461 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  38.49 
 
 
466 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  37.55 
 
 
470 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  37.56 
 
 
461 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  42.58 
 
 
461 aa  296  5e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.29 
 
 
460 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.27 
 
 
478 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.26 
 
 
475 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 
468 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.93 
 
 
470 aa  292  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.39 
 
 
469 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  38.27 
 
 
471 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.87 
 
 
474 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  39.06 
 
 
483 aa  290  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  37.14 
 
 
462 aa  289  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  42.15 
 
 
467 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 
457 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 
473 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.58 
 
 
758 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.18 
 
 
458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.93 
 
 
472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  41.18 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  35.89 
 
 
457 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.99 
 
 
459 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.76 
 
 
890 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  35.43 
 
 
462 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.48 
 
 
456 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  38.96 
 
 
461 aa  280  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  40.92 
 
 
453 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.73 
 
 
482 aa  279  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.17 
 
 
461 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.6 
 
 
457 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 
481 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39 
 
 
499 aa  276  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 
460 aa  276  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  42.32 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  37.63 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.26 
 
 
887 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>