More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0766 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
441 aa  842    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  60 
 
 
447 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  61.38 
 
 
451 aa  411  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.82 
 
 
478 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  52.86 
 
 
455 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.15 
 
 
442 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  54.18 
 
 
453 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.55 
 
 
456 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  56.36 
 
 
473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.77 
 
 
456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.47 
 
 
449 aa  348  9e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  49.53 
 
 
455 aa  343  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  48.31 
 
 
461 aa  343  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  54.08 
 
 
489 aa  342  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  47.84 
 
 
506 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.91 
 
 
453 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.91 
 
 
458 aa  329  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.92 
 
 
460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.31 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  44.82 
 
 
479 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.23 
 
 
457 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.23 
 
 
457 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.23 
 
 
457 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  47.4 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  41.25 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  41.08 
 
 
461 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.29 
 
 
459 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.73 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  45.23 
 
 
460 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  41.49 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  39.57 
 
 
459 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.77 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.77 
 
 
470 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.67 
 
 
470 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.77 
 
 
470 aa  302  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.77 
 
 
470 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.77 
 
 
470 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.55 
 
 
457 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  42.69 
 
 
455 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.29 
 
 
470 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.29 
 
 
470 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.53 
 
 
470 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  38.86 
 
 
461 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.1 
 
 
461 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  40.05 
 
 
470 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  40.05 
 
 
470 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.49 
 
 
459 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  46.9 
 
 
459 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.37 
 
 
460 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  43.36 
 
 
464 aa  296  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.77 
 
 
459 aa  295  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.21 
 
 
469 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.53 
 
 
464 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  39.37 
 
 
461 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.36 
 
 
462 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.06 
 
 
457 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.43 
 
 
464 aa  294  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  45.41 
 
 
455 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  38.37 
 
 
462 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  43.08 
 
 
470 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  47.74 
 
 
482 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.95 
 
 
460 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  41.25 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.5 
 
 
461 aa  289  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40.38 
 
 
466 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  44.22 
 
 
496 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40.77 
 
 
462 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.03 
 
 
473 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.37 
 
 
453 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.36 
 
 
460 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  39.09 
 
 
461 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.14 
 
 
460 aa  286  7e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.14 
 
 
460 aa  286  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  41.65 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.13 
 
 
460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.9 
 
 
464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  41.83 
 
 
462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  38.55 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.52 
 
 
460 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  36.82 
 
 
456 aa  281  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.71 
 
 
461 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.21 
 
 
471 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.33 
 
 
457 aa  279  9e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.28 
 
 
464 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.53 
 
 
459 aa  277  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  42 
 
 
462 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.95 
 
 
451 aa  276  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.65 
 
 
469 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  42.32 
 
 
458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  38.6 
 
 
474 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.65 
 
 
483 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.06 
 
 
471 aa  269  7e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  38.46 
 
 
498 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  41.53 
 
 
461 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  36.9 
 
 
499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  39.63 
 
 
471 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  36.24 
 
 
460 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  36.84 
 
 
499 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  34.86 
 
 
460 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>