More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2155 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 451 aa  900    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  47.6 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.3 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.3 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.3 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.06 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  46.15 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  49.32 
 
 		 455 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.86 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  47.26 
 
 		 455 aa  358  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.35 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  45.7 
 
 		 455 aa  355  6.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  46.8 
 
 		 453 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  45.12 
 
 		 479 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.14 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.03 
 
 		 442 aa  329  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.54 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.78 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  47.09 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.31 
 
 		 464 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  43.62 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.44 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  47.95 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.05 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.16 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  41.52 
 
 		 462 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.97 
 
 		 456 aa  299  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.96 
 
 		 469 aa  296  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  45.66 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  40.36 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.62 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.84 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  44.42 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  40.09 
 
 		 497 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.6 
 
 		 497 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  39.59 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  41.35 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.32 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40.82 
 
 		 466 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.09 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.82 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.42 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  37.89 
 
 		 472 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.22 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.7 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.7 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.09 
 
 		 470 aa  286  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  39.24 
 
 		 462 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  40.41 
 
 		 503 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.85 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.34 
 
 		 460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.37 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.61 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.37 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.81 
 
 		 460 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.61 
 
 		 470 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.37 
 
 		 470 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  38.13 
 
 		 470 aa  282  9e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  38.13 
 
 		 470 aa  282  9e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.37 
 
 		 496 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  44.44 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.07 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  39.41 
 
 		 461 aa  279  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.47 
 
 		 499 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.95 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  40.47 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  40.23 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  39.58 
 
 		 497 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.58 
 
 		 497 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 		 503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.35 
 
 		 497 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.55 
 
 		 481 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1781  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.55 
 
 		 501 aa  272  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.62 
 
 		 471 aa  272  9e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  39.77 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.37 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  39 
 
 		 497 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  39.68 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.55 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.32 
 
 		 485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.52 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.52 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.04 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39 
 
 		 482 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.26 
 
 		 483 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  40.72 
 
 		 498 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.1 
 
 		 497 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.42 
 
 		 496 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  39.86 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  35.1 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  39.62 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.09 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  39.77 
 
 		 487 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.8 
 
 		 492 aa  266  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.49 
 
 		 464 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 		 497 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.28 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.64 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  37.5 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>