More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4307 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 447 aa  850    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  60 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  60.9 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.3 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.15 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.64 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.56 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  51.9 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  53.15 
 
 		 489 aa  356  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  49.32 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  50.79 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.79 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.54 
 
 		 460 aa  342  9e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  46.68 
 
 		 455 aa  332  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  44.84 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  49.89 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.21 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  44.72 
 
 		 479 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  45.96 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.52 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.52 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.52 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.29 
 
 		 453 aa  308  9e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  46.24 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  46.82 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.56 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.04 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  40.87 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.14 
 
 		 470 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  41.94 
 
 		 461 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.44 
 
 		 464 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  44.06 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  39.29 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.39 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  41.79 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.23 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  44.22 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.72 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  44.58 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.41 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.48 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.8 
 
 		 461 aa  289  7e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.42 
 
 		 470 aa  289  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.42 
 
 		 470 aa  289  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  39.05 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  40.96 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.66 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.42 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.18 
 
 		 470 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.42 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.18 
 
 		 470 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.42 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.42 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  44.29 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.52 
 
 		 459 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.99 
 
 		 462 aa  286  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 462 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.18 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.43 
 
 		 459 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.9 
 
 		 460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.43 
 
 		 457 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  39.71 
 
 		 466 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  39.76 
 
 		 461 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  38.55 
 
 		 461 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  43.27 
 
 		 464 aa  282  9e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.69 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.29 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.88 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.94 
 
 		 470 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  39.23 
 
 		 459 aa  279  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.75 
 
 		 466 aa  279  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  39.47 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  39.47 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.92 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.28 
 
 		 473 aa  276  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  41.99 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.15 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.76 
 
 		 466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.08 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  41.46 
 
 		 481 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.31 
 
 		 460 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.43 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.71 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.71 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.38 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  40.92 
 
 		 457 aa  270  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  36.58 
 
 		 460 aa  269  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.5 
 
 		 481 aa  269  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.71 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.6 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  38.5 
 
 		 466 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.58 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.95 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.71 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  41.94 
 
 		 460 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  36.93 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  39.59 
 
 		 456 aa  259  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  41.14 
 
 		 461 aa  259  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>