More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22220 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 
496 aa  994    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.8 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  50.11 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.51 
 
 
460 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.93 
 
 
457 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.93 
 
 
457 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.93 
 
 
457 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  45.53 
 
 
461 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  48.55 
 
 
455 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  45.83 
 
 
455 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.81 
 
 
464 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.15 
 
 
453 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  45.14 
 
 
470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.93 
 
 
453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  45.73 
 
 
453 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.37 
 
 
464 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  45.45 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  44.42 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  45.23 
 
 
460 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  45.87 
 
 
455 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.52 
 
 
442 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.76 
 
 
456 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  40.49 
 
 
479 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.05 
 
 
453 aa  326  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.67 
 
 
449 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.36 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42 
 
 
451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  44.22 
 
 
441 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 
472 aa  297  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  40.65 
 
 
506 aa  297  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.51 
 
 
461 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  38.84 
 
 
466 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.56 
 
 
470 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.85 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.61 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.85 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.61 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.85 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  38.81 
 
 
481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  35.38 
 
 
470 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  35.38 
 
 
470 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.61 
 
 
470 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  34.62 
 
 
459 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.61 
 
 
470 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 
464 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  37.92 
 
 
462 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.71 
 
 
460 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.99 
 
 
469 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.38 
 
 
470 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  33.76 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.51 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  35.33 
 
 
462 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  37.47 
 
 
462 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  36.73 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  37.47 
 
 
462 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  33.97 
 
 
466 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.73 
 
 
457 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  35.19 
 
 
457 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.59 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  35.75 
 
 
461 aa  270  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.18 
 
 
460 aa  270  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.73 
 
 
460 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.73 
 
 
460 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.01 
 
 
459 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 
459 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.5 
 
 
473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  43.36 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  35.07 
 
 
461 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  42.32 
 
 
451 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.3 
 
 
475 aa  266  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  35.97 
 
 
462 aa  264  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.99 
 
 
478 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.7 
 
 
493 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  36.98 
 
 
458 aa  263  4.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  38.05 
 
 
498 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  36.71 
 
 
500 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  35.94 
 
 
497 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  33.02 
 
 
456 aa  261  1e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  33.76 
 
 
459 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  37.35 
 
 
457 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  32.39 
 
 
460 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.74 
 
 
460 aa  261  3e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  33.76 
 
 
459 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.92 
 
 
493 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.15 
 
 
473 aa  259  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.53 
 
 
497 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.83 
 
 
457 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.24 
 
 
459 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.12 
 
 
497 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.26 
 
 
479 aa  256  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  33.78 
 
 
461 aa  256  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.16 
 
 
459 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.41 
 
 
488 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.16 
 
 
484 aa  256  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.98 
 
 
499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.65 
 
 
462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  41.11 
 
 
489 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  35.03 
 
 
482 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.62 
 
 
460 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>