More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2428 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 455 aa  886    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  66.82 
 
 		 460 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  62.42 
 
 		 470 aa  524  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  63.18 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.35 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  53.27 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  52.3 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.91 
 
 		 453 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  49.23 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.03 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.03 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.03 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  50.9 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  51.58 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.56 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  53.29 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.11 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.9 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.85 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  50.8 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  49.89 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.66 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  43.67 
 
 		 472 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.87 
 
 		 456 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.54 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.3 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.3 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  43.3 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  49.55 
 
 		 441 aa  346  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.34 
 
 		 449 aa  345  6e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  42.82 
 
 		 470 aa  345  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.82 
 
 		 470 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  42.58 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  42.58 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.79 
 
 		 466 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.58 
 
 		 470 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.58 
 
 		 470 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.82 
 
 		 459 aa  339  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.34 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.71 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.97 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  41.81 
 
 		 461 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.67 
 
 		 453 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  40.09 
 
 		 459 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.52 
 
 		 451 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  49.77 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.67 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38.46 
 
 		 456 aa  325  8.000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  41.39 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.61 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  42.99 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.43 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.87 
 
 		 469 aa  323  3e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.01 
 
 		 457 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40.88 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  44.39 
 
 		 484 aa  322  7e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.27 
 
 		 457 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  41.86 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  49.66 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  40.66 
 
 		 457 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 		 459 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  40.75 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  41.14 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.76 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.66 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.95 
 
 		 460 aa  319  7e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.95 
 
 		 460 aa  319  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.95 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  43.17 
 
 		 466 aa  317  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.06 
 
 		 497 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  48.25 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.58 
 
 		 459 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.93 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37.69 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  46.3 
 
 		 506 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.63 
 
 		 464 aa  309  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.96 
 
 		 501 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  42.79 
 
 		 499 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.01 
 
 		 496 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.35 
 
 		 499 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  46.9 
 
 		 459 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  43.54 
 
 		 497 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  42.55 
 
 		 499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.58 
 
 		 473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  40.66 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  43.47 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  41.59 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  44.89 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.33 
 
 		 497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.26 
 
 		 481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  43.2 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.24 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.24 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.96 
 
 		 497 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.76 
 
 		 499 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.48 
 
 		 497 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  41.59 
 
 		 499 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>