More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0127 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
455 aa  899    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.99 
 
 
458 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.76 
 
 
464 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  53.17 
 
 
461 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  52.21 
 
 
460 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.31 
 
 
453 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.98 
 
 
457 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.54 
 
 
464 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.98 
 
 
457 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.98 
 
 
457 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.43 
 
 
453 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  51.09 
 
 
479 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  49 
 
 
455 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  53.09 
 
 
441 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  50.91 
 
 
455 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  50.11 
 
 
496 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  49.22 
 
 
455 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  51.42 
 
 
453 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.88 
 
 
442 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  51.23 
 
 
482 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.67 
 
 
453 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  44.18 
 
 
472 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  48.53 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  46.89 
 
 
462 aa  356  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  44.16 
 
 
466 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  41.3 
 
 
470 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  41.3 
 
 
470 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  41.53 
 
 
470 aa  348  8e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.53 
 
 
470 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  41.3 
 
 
470 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.3 
 
 
470 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.53 
 
 
470 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.07 
 
 
470 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44 
 
 
462 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.53 
 
 
470 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.14 
 
 
464 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.84 
 
 
470 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.07 
 
 
470 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  41.46 
 
 
459 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.59 
 
 
449 aa  343  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  43.81 
 
 
470 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  49.22 
 
 
451 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.18 
 
 
459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.28 
 
 
460 aa  339  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  44.08 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  39.4 
 
 
456 aa  336  5e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  42.12 
 
 
466 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.62 
 
 
466 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 
464 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.68 
 
 
460 aa  334  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.52 
 
 
456 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.87 
 
 
758 aa  333  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  43.42 
 
 
462 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.72 
 
 
461 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  43.2 
 
 
462 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  47.58 
 
 
459 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.58 
 
 
451 aa  329  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 
461 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  42.82 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40.32 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.18 
 
 
457 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  39.5 
 
 
461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  39.56 
 
 
461 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.78 
 
 
469 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.62 
 
 
457 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.79 
 
 
456 aa  323  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  42.34 
 
 
459 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.37 
 
 
459 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  37.39 
 
 
460 aa  318  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 
460 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.93 
 
 
478 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.98 
 
 
473 aa  316  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  39.55 
 
 
457 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.32 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  45.01 
 
 
481 aa  313  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  38.86 
 
 
462 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  37.31 
 
 
460 aa  312  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  41.03 
 
 
483 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.07 
 
 
459 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  46.68 
 
 
447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.1 
 
 
460 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.87 
 
 
459 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.1 
 
 
457 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  47.1 
 
 
473 aa  309  6.999999999999999e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  47.31 
 
 
489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  40.27 
 
 
464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37.22 
 
 
462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  37.69 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  43.37 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  43.37 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.47 
 
 
890 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.54 
 
 
475 aa  303  6.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.72 
 
 
497 aa  302  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.89 
 
 
471 aa  302  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.6 
 
 
461 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  41.85 
 
 
457 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>