More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4464 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  77.11 
 
 		 455 aa  688    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  91.17 
 
 		 453 aa  828    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  87.33 
 
 		 457 aa  792    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  87.33 
 
 		 457 aa  792    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  87.33 
 
 		 457 aa  792    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 453 aa  905    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  67.78 
 
 		 455 aa  624  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.91 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  51.87 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.78 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  52.93 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  48.36 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  50.68 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.34 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.03 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  46.14 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.89 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  46.44 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  46.58 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  45.51 
 
 		 462 aa  345  8.999999999999999e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  46.67 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.71 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.58 
 
 		 470 aa  332  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.82 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.82 
 
 		 470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  47.07 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.35 
 
 		 451 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.03 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  43.59 
 
 		 470 aa  325  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  43.36 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.36 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.59 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  43.12 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  43.12 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.1 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.59 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  42.29 
 
 		 472 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.33 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  46.58 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.64 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.21 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.87 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42.82 
 
 		 466 aa  312  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.76 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  40.57 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.04 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 		 462 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  40.05 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  39.35 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  39 
 
 		 460 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.48 
 
 		 457 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.33 
 
 		 459 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  39.51 
 
 		 499 aa  302  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  40.84 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.33 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.33 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.4 
 
 		 499 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39.74 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.33 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.87 
 
 		 464 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.5 
 
 		 459 aa  299  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  40.4 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  40.67 
 
 		 499 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  39.63 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  40.62 
 
 		 499 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  42.24 
 
 		 499 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  39.91 
 
 		 499 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  40.84 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  41.06 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.12 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 503 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.67 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  40.6 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  39.74 
 
 		 499 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.74 
 
 		 459 aa  293  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  46.06 
 
 		 489 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  39.86 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.14 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  37.76 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  44.84 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  41.05 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.15 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  41.15 
 
 		 496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  41.15 
 
 		 499 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  41.15 
 
 		 496 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  41.15 
 
 		 496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  40.6 
 
 		 499 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.96 
 
 		 483 aa  289  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  43.02 
 
 		 506 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.48 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  40.6 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  40.91 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  40.91 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  38.04 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  39.96 
 
 		 499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  38.02 
 
 		 489 aa  286  5e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  40.37 
 
 		 499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.91 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  44.29 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>