More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4261 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 455 aa  904    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.22 
 
 		 453 aa  628  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  69.13 
 
 		 457 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  69.13 
 
 		 457 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  69.13 
 
 		 457 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.78 
 
 		 453 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  66.89 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  64 
 
 		 453 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  51.37 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.34 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  50.23 
 
 		 482 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.89 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  49 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  48.19 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  51.72 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  47.62 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  47.85 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.69 
 
 		 464 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  47.06 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.88 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.6 
 
 		 451 aa  340  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.83 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45 
 
 		 449 aa  322  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  44.86 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.28 
 
 		 470 aa  312  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.04 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.04 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.04 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  38.8 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  38.8 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.04 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.04 
 
 		 470 aa  309  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.04 
 
 		 470 aa  308  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  40.8 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.55 
 
 		 470 aa  306  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  39.62 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.8 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.56 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.51 
 
 		 469 aa  302  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.44 
 
 		 499 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.3 
 
 		 460 aa  300  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38.42 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.67 
 
 		 499 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.86 
 
 		 497 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.35 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.38 
 
 		 466 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.72 
 
 		 464 aa  296  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.86 
 
 		 461 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  39.91 
 
 		 499 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.64 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  40.88 
 
 		 498 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  42.22 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  38.37 
 
 		 489 aa  294  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.41 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.59 
 
 		 460 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  39.23 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  41.11 
 
 		 499 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40.72 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  38 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  43.46 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  41.13 
 
 		 495 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  38.14 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.05 
 
 		 475 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  38.66 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  40.18 
 
 		 503 aa  289  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  38.89 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  39.37 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.08 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  39.16 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  38.44 
 
 		 499 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.74 
 
 		 459 aa  285  9e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.28 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.22 
 
 		 486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  39.11 
 
 		 499 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  39.9 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  38.89 
 
 		 499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  38.11 
 
 		 499 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  37.25 
 
 		 492 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  37.5 
 
 		 490 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.62 
 
 		 488 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.61 
 
 		 461 aa  282  8.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.62 
 
 		 488 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.8 
 
 		 485 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  40.32 
 
 		 499 aa  282  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  36.1 
 
 		 460 aa  282  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 		 503 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  37.64 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  38.13 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.89 
 
 		 459 aa  280  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.52 
 
 		 496 aa  280  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.84 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  39.52 
 
 		 496 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  39.52 
 
 		 496 aa  279  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  39.52 
 
 		 499 aa  279  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  39.52 
 
 		 496 aa  279  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.65 
 
 		 494 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>